约定的条款没有写在协议里，其效力需分情况判断，具体如下：

1. 若约定有效的情况：

   • 双方真实意思表示：如果该约定是双方真实意愿的体现，没有违背法律法规的强制性规定以及公序良俗等原则，那么在某些特定的情况下，它是有可能被认定为有效的。例如，双方在合同谈判过程中，已经就某些关键条款达成了一致，并且也实际按照这些约定进行了履行，即使这些约定并没有被写入正式的合同文本中，根据法律的精神和实践，它们也可能被视为合同的一部分，具有法律效力。
   • 有证据证明：如果有证据（如聊天记录、录音、证人证言等）能够证明该约定的存在以及其具体内容，那么该约定在发生纠纷时可以作为证据，具有法律效力。

2. 若约定可能无效的情况：

   • 法律明确要求书面形式：某些法律明确要求合同必须采用书面形式，若未以书面形式呈现相关约定，该约定可能不具法律效力。例如，建设工程合同等，如果相关约定没有以书面形式明确，那么在发生纠纷时，可能无法得到法律的保护。
   • 缺乏证据证明：如果没有足够充分的证据来证明该约定的存在以及其具体内容，那么一旦出现纠纷，主张该约定有效的一方将会面临极大的举证困难。在法律程序中，举证责任是由主张自己权利的一方承担的。如果无法提供有效的证据，那么法院很可能不会支持其主张，该约定也就无法得到法律的保护。

法律建议：

• 为了避免在合同履行过程中出现后续的纠纷，对于那些重要的约定，应该尽量将其写入正式的合同中。这样可以通过书面的形式明确双方的权利和义务，减少因约定不明确而导致的争议和法律风险。
• 在合同签订前，双方也应该对重要的约定进行充分的沟通和确认，以确保其合法性和有效性。如果确实存在无法写入合同的约定，建议双方通过其他方式（如补充协议、备忘录等）进行确认，并保留好相关证据。

可能法律后果：

• 如果未写入合同的约定被认定为有效，那么双方应当按照该约定履行义务，否则可能构成违约，需要承担相应的法律责任。
• 如果未写入合同的约定被认定为无效或无法证明其存在及内容，那么在发生纠纷时，主张该约定有效的一方可能无法得到法律的支持，从而面临损失。

因此，在签订合同时，务必确保所有重要约定都明确写入合同文本中，以保障双方的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。