仲裁判决的工资是否可以由员工自行申报个税，取决于所得的性质、金额以及是否存在税收优惠政策。以下是对此问题的详细分析：
一、正常工资收入
如果劳动仲裁裁定用人单位支付给劳动者的款项属于正常的工资、薪金所得范畴，如拖欠的工资、未足额发放的工资等，那么这些收入需要计入个人综合所得，并依法进行个人所得税的计算和缴纳。
- 计税方式：我国个人所得税实行综合所得按年计征的方式，应纳税所得额以每月收入额减除费用五千元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额为准。
- 纳税义务：若在一个纳税年度内，包括劳动仲裁所获工资在内的综合所得达到或超过年度综合所得的起征点（目前为6万元），就需要依法缴纳个人所得税。
- 申报方式：通常情况下，支付所得的单位或个人（即用人单位）会作为扣缴义务人，在支付工资时代扣代缴个人所得税。但员工也有义务自行申报和缴纳，特别是在用人单位未履行扣缴义务时。
二、经济补偿或赔偿金
对于劳动仲裁中涉及的经济补偿或赔偿金，其税务处理与正常工资收入有所不同。
一般规定：
- 若个人与用人单位解除劳动关系取得的一次性补偿收入（包括经济补偿金、生活补助费和其他补助费用）在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税。
- 超过3倍数额的部分，则不并入当年综合所得，而是单独适用综合所得税率表进行计算纳税。
特殊情况：
- 在某些特殊情况下，劳动仲裁获得的收入可能享受税收优惠或免征个人所得税。例如，因身体受到伤害而获得的医疗费、生活补助费等合理且必要的支出，根据税法规定可以免征个人所得税。
- 此外，国家统一规定的某些补贴、津贴等也可能在一定程度上减免个人所得税。
三、申报与缴纳建议
- 及时咨询：建议劳动者在收到劳动仲裁相关款项后，及时咨询专业的税务机构或律师，以便准确了解自己的税务义务。
- 合法申报：根据税务机构或律师的建议，进行合法的税务申报和缴纳。如果用人单位未履行扣缴义务，员工应自行向税务机关申报并缴纳税款。
- 保留证据：同时，劳动者也应注意保留好相关证据和文件，如劳动仲裁裁决书、工资单、经济补偿协议等，以备不时之需。
总结来说，仲裁判决的工资是否可以由员工自行申报个税，需根据所得的性质、金额以及是否存在税收优惠政策来判断。在大多数情况下，正常工资收入需要由用人单位代扣代缴个人所得税，但员工也有自行申报和缴纳的义务。对于经济补偿或赔偿金，其税务处理则更为复杂，需要根据具体情况来判断。因此，建议劳动者在收到相关款项后，及时咨询专业人士以确保合法合规地处理税务事宜。