结论：仲裁后给员工的赔偿5000元是否需要申报个税，取决于该赔偿的性质。若属于工伤赔偿，则通常无需缴纳个人所得税；若属于工资薪金性质的赔偿，则需依法申报并缴纳个人所得税。

分析：

1. 工伤赔偿情况：

   • 根据《中华人民共和国个人所得税法》第四条第四项的规定，按照国家统一规定发给干部、职工的安家费、退职费、基本养老金或者退休费、离休费、离休生活补助费，以及工伤赔偿等，免征个人所得税。
   • 因此，如果仲裁后给员工的5000元赔偿属于工伤赔偿范畴，如一次性伤残补助金、一次性工伤医疗补助金等，那么这部分赔偿是无需缴纳个人所得税的，也就不需要进行个税申报。

2. 工资薪金性质赔偿情况：

   • 如果仲裁后给员工的赔偿并非工伤赔偿，而是与工资薪金相关的赔偿，如因拖欠工资而支付的赔偿金，那么这部分赔偿在性质上可能被视为工资薪金的一部分。
   • 根据《中华人民共和国个人所得税法》第二条的规定，工资、薪金所得应当缴纳个人所得税。因此，在这种情况下，员工需要就这部分赔偿依法申报并缴纳个人所得税。
   • 计算公式（若需计算税额）：应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数。其中，应纳税所得额 = 赔偿金额 - 起征点（目前为5000元/月，但需注意，若赔偿金额与当月工资薪金合并计算，则起征点只扣除一次）。适用税率和速算扣除数则根据应纳税所得额的大小，按照个人所得税税率表进行确定。不过，由于本题中赔偿金额为5000元，且未提及是否与当月工资薪金合并计算，因此在实际操作中可能因具体情况而有所不同。若单独计算且不考虑其他扣除项，由于5000元未超过起征点，因此无需缴纳个人所得税。

建议：

• 员工在收到仲裁赔偿后，应首先确认赔偿的性质，以判断是否需要缴纳个人所得税。
• 如果对赔偿性质或个税申报有疑问，建议及时咨询专业税务人员或律师，以确保合规操作。
• 如有任何法律问题，特别是涉及劳动工伤、工资福利等方面的疑问，可以直接向我咨询，我将提供专业的法律意见和帮助。