结论前置：员工领取一次性医疗补助是否需要与公司签订协议，需分情况讨论，具体如下：

1. 若属于工伤保险待遇范畴
   根据《工伤保险条例》第三十七条，员工因工致残被鉴定为五级至十级伤残的，在解除或终止劳动合同时，工伤保险基金需支付一次性工伤医疗补助金，用人单位支付一次性伤残就业补助金。

   • 协议必要性：若补助金由工伤保险基金支付，通常无需单独与公司签订协议，因支付主体为社保部门，流程由工伤保险基金直接办理。
     
   • 例外情形：若用人单位需承担一次性伤残就业补助金，或双方对补助金额、支付时间存在争议，则建议签订书面协议，明确权利义务，避免后续纠纷。

2. 若属于非工伤医疗补助（如公司福利或补充协议）
   若公司自愿提供一次性医疗补助（非法定义务），例如因病离职补助、特殊岗位健康补偿等，则必须签订书面协议。

   • 法律依据：根据《民法典》第四百七十条，民事主体之间设立、变更、终止民事权利义务关系的协议，应以书面形式明确。
     
   • 协议内容：需包含补助金额、支付条件、支付时间、违约责任等条款，确保双方权益。未签订协议可能导致公司拒付或员工主张权利缺乏依据。

3. 若涉及劳动争议或协商解除
   若员工因医疗期满不能从事原工作，与公司协商解除劳动合同并领取补助，则必须签订解除协议。

   • 协议要点：根据《劳动合同法》第三十六条，协商解除需明确经济补偿（包括医疗补助）的金额及支付方式。未签订协议可能导致公司被认定为违法解除，需支付双倍赔偿金。

实务建议：

• 员工应要求公司出具书面文件，明确补助性质、金额及支付主体（社保/公司）。
  
• 若公司拒绝签订协议，可要求其通过银行转账备注款项用途，或保留录音、聊天记录等证据。
  
• 发生争议时，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，主张未签订协议的赔偿责任。
  

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