员工辞退补偿金在双方协商一致的情况下，是可以分多次发放的，但需确保支付安排符合法律规定，避免纠纷。以下是对此问题的详细分析：

一、辞退补偿金的一般发放原则

根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位在与劳动者解除或终止劳动合同时，应依法一次性支付经济补偿。这通常意味着，在正常情况下，辞退补偿金应当一次性付清。然而，法律也并未完全禁止双方就补偿金的支付方式进行协商，包括分多次发放的可能性。

二、分多次发放的合法性及条件

1. 双方协商一致：如果用人单位和劳动者就辞退补偿金的分多次发放达成了一致意见，并且这种安排不违反法律的强制性规定，那么这种分多次发放的方式是合法的。
2. 符合法律规定：在分次支付的情况下，应确保支付安排符合《中华人民共和国劳动合同法》第五十条的规定，即用人单位应当在办结工作交接时支付经济补偿。这意味着，分次支付不应影响劳动者及时获得其应得的补偿。
3. 避免纠纷：为了避免可能的纠纷，双方最好在解除或终止劳动合同的协议中明确约定补偿金的支付方式、时间和金额等细节。

三、分多次发放可能带来的问题及建议

1. 支付延迟风险：分多次发放可能增加支付延迟的风险，如果用人单位财务状况出现问题，可能导致劳动者无法按时获得全部补偿。因此，劳动者在接受分多次发放的安排时，应谨慎评估用人单位的财务状况和信誉。
2. 明确约定细节：为了避免纠纷，双方应在协议中明确约定每次支付的时间、金额和方式等细节。如果可能的话，还可以约定违约责任和争议解决方式等条款。
3. 法律咨询：在接受分多次发放的安排前，劳动者可以咨询专业律师或法律机构，以确保自己的权益得到充分保障。

四、特殊情况下的处理

如果用人单位违反法律规定解除或终止劳动合同，劳动者不要求继续履行劳动合同或者劳动合同已经不能继续履行的，用人单位应当依照《中华人民共和国劳动合同法》第八十七条规定支付赔偿金，即依照第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。在这种情况下，赔偿金的支付也应遵守相关法律规定，通常应一次性支付，除非双方有特别约定且符合法律规定。

温馨提示：员工辞退补偿金在双方协商一致且符合法律规定的情况下，是可以分多次发放的。但为了避免可能的纠纷和风险，双方应在协议中明确约定支付细节，并在必要时咨询专业律师。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。