贷款人死后，担保人已代为偿还贷款，后来发现贷款人留有遗产，可通过法律途径追回已代偿款项。

一. 分析案情与法律依据

1. 担保人代偿情况：根据描述，担保人已经代为偿还了贷款人的贷款，这意味着担保人承担了原本应由贷款人承担的债务责任。
2. 贷款人遗产发现：在担保人代偿后，发现贷款人留有遗产。根据《民法典》的相关规定，债务人的遗产应当用于清偿其生前所负债务。
3. 法律依据：《民法典》第一千一百六十一条规定：“继承人以所得遗产实际价值为限清偿被继承人依法应当缴纳的税款和债务”。这表明，如果贷款人的遗产足以清偿其债务，那么其遗产继承人应当用遗产来清偿债务。

二. 追回已代偿款项的途径

1. 确定遗产范围：首先，需要确定贷款人留下的遗产范围和价值，这通常需要通过法律程序，如遗产继承诉讼或遗产清算程序来进行。
2. 提出追偿请求：在确定了遗产范围后，担保人可以向遗产继承人或遗产管理人提出追偿请求，要求用遗产来清偿自己已代偿的贷款。
3. 法律途径解决争议：如果遗产继承人或遗产管理人拒绝清偿债务，担保人可以通过法律途径解决争议，如提起诉讼或申请仲裁。

三. 结论与建议

综上所述，担保人已经代为偿还了贷款人的贷款，后来发现贷款人留有遗产，可以通过法律途径追回已代偿款项。建议担保人首先确定遗产范围和价值，然后向遗产继承人或遗产管理人提出追偿请求。如果遭遇拒绝或争议，可以寻求法律帮助，通过诉讼或仲裁等方式来维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。