针对调解协议中有减免利息但法院执行未能执行的情况，您可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 与执行法官积极沟通：

   • 首先，您应当主动与负责执行该调解协议的法官取得联系，详细说明情况，包括调解协议的具体内容、减免利息的条款以及目前执行未能进行的原因。
   • 提供被执行人的财产线索或其他相关信息，协助法院执行工作的开展。例如，如果被执行人有房产、车辆或其他可执行财产，您应当及时告知法院。

2. 申请强制执行：

   • 若被执行人有履行能力却故意拖延或拒绝执行调解协议中的义务，包括减免利息后的剩余债务，您可以向法院申请强制执行。
   • 法院将采取一系列强制手段，如查封、扣押、拍卖被执行人的财产等，以促使被执行人履行义务。

3. 请求法院采取强制措施：

   • 依据《中华人民共和国民事诉讼法》等相关法律法规，您可以请求法院对被执行人采取拘留、罚款等强制措施。
   • 这些措施旨在增加被执行人不履行义务的成本，迫使其履行调解协议中的义务。

4. 利用征信系统进行信用惩戒：

   • 您还可以通过征信系统等途径对被执行人进行信用惩戒。例如，将被执行人列入失信被执行人名单，限制其高消费行为等。
   • 信用惩戒可以增加被执行人的社会压力和经济成本，从而促使其履行义务。

5. 考虑提起诉讼或申请再审：

   • 如果您认为调解协议本身存在法律问题或执行过程中存在违法行为，您可以考虑提起诉讼或申请再审。
   • 例如，如果调解协议是在被欺诈、胁迫等情况下签订的，或者执行过程中存在程序违法等问题，您可以通过法律途径来维护自己的权益。

在采取上述措施时，您需要注意以下几点：

• 确保您提供的所有信息和证据都是真实、准确的，以避免因虚假陈述或证据不足而导致的法律风险。
• 遵循法律程序和规定，不要采取非法手段来迫使被执行人履行义务。
• 如果您对法律程序或规定不熟悉，建议咨询专业律师以获取更详细的指导和帮助。

若您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律服务。