运输合同只有签字没有按手印，在一般情况下是有效的。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

法律依据角度

根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条的规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这一条款明确了签字、盖章和按指印在合同签订中的法律地位，它们都是确认当事人身份和意思表示的有效手段，具有同等的法律效力。因此，在运输合同中，只要签字是真实的，且合同内容合法合规，合同即具备法律效力，无需必须按手印。

合同效力构成要件角度

要使运输合同有效，需满足以下条件：

1. 行为人具有相应的民事行为能力：签订运输合同的双方都必须具备独立实施民事法律行为的资格和能力。这包括完全民事行为能力人能够独立签订的合同，以及限制民事行为能力人在其能力范围内或经法定代理人追认后签订的合同。
2. 意思表示真实：当事人在签订运输合同时的表示必须反映其内心的真实意愿，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。如果合同是在这些不正当手段下签订的，受影响的当事人有权请求法院或仲裁机构撤销该合同。
3. 不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗：运输合同的内容必须严格遵守法律和行政法规的规定，不得损害国家利益、社会公共利益和他人的合法权益，也不能违背社会的公共秩序和善良风俗。

只要运输合同满足上述条件，且签字是真实的，那么即使没有按手印，合同也是有效的。

特殊情形角度

虽然签字是合同成立和生效的主要条件，但按手印在某些特殊情况下可能起到进一步确认的作用。例如，当合同存在争议，对签字的真实性产生怀疑时，按手印的唯一性和稳定性可能会为证明合同的有效性提供更有力的支撑。然而，这并不意味着没有按手印的合同就无效。在大多数情况下，只要签字是真实的，且合同内容合法合规，合同就是有效的。

特别约定角度

如果运输合同中特别约定了需要按手印作为合同生效的条件，那么应当按照约定来履行。否则，可能会影响合同的效力。但这种情况属于特殊约定，并非普遍适用。在大多数运输合同中，并没有这样的特别约定。

实际操作建议角度

为了确保运输合同的真实性和有效性，并减少未来可能出现的纠纷，建议双方在签订合同时尽量按照法律规定和双方的约定，完成所有必要的确认手续。这不仅包括签字，还可能包括盖章或按手印等其他方式，具体取决于合同的性质和双方的约定。但无论如何，签字都是合同成立和生效的主要条件。

总结与建议：

运输合同只有签字没有按手印，在一般情况下是有效的。但为了确保合同的法律效力和减少纠纷，建议双方在签订合同时尽量完成所有必要的确认手续。如果对运输合同的签订和效力问题还有疑问，可以直接向我咨询，我会提供专业的法律意见。