可以在车主所在法院起诉欠运费不给的案件，但需根据具体情况判断管辖法院。以下从不同角度为您详细分析：

1. 一般原则：被告住所地法院管辖

根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，对公民提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖。在欠运费不给的案件中，如果车主（即被告）的住所地明确，且您选择在其住所地法院起诉，这是符合法律规定的。例如，若车主户籍所在地或经常居住地（需连续居住满一年以上）在某地，您可以在该地法院提起诉讼。

2. 特殊情形：合同履行地法院管辖

除了被告住所地法院外，如果欠运费纠纷涉及运输合同，且合同中有明确约定履行地，或者根据合同性质能够确定履行地（如货物起运地、到达地等），您也可以选择在合同履行地法院起诉。这一规定依据《中华人民共和国民事诉讼法》中关于合同纠纷管辖的规定，旨在方便当事人诉讼，减少诉讼成本。

举例说明：

• 若您与车主签订的运输合同中明确约定运费支付地为某地，且该地与车主住所地不一致，您可以选择在该地法院起诉。
• 若合同未明确约定履行地，但根据运输路线、货物交接情况等能够合理推断出履行地，您同样可以在该地法院提起诉讼。

3. 协议管辖：双方约定优先

如果双方在运输合同中明确约定了争议解决方式，如“发生争议，由某地法院管辖”，则应遵循该约定。这一规定体现了当事人意思自治原则，在合同纠纷中尤为重要。

注意事项：

• 协议管辖需明确、具体，且不得违反级别管辖和专属管辖的规定。
• 若协议管辖条款存在模糊、歧义或违反法律强制性规定的情况，可能被认定为无效。

4. 实际操作建议

• 收集证据：在起诉前，务必收集好与欠运费相关的证据，如运输合同、运费结算单、沟通记录等，以证明您的主张。
• 确定管辖法院：根据上述原则，结合案件具体情况，确定最有利的管辖法院。
• 撰写起诉状：明确诉讼请求、事实与理由，并附上相关证据材料。
• 提交法院：将起诉状及相关证据材料提交至选定的管辖法院，并按照法院要求缴纳诉讼费用。

总结：在欠运费不给的案件中，您可以选择在车主所在法院起诉，但需根据具体情况判断管辖法院。如果合同中有明确约定履行地或双方约定了争议解决方式，应优先遵循这些约定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。