员工偷金3万元，报警后应由公安机关立案侦查，并根据盗窃金额及情节依法处理。

一. 报警及立案

1. 报警处理：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百一十条，任何单位和个人发现有犯罪事实或者犯罪嫌疑人，有权利也有义务向公安机关报案。因此，发现员工偷金3万元，应立即向当地公安机关报警，详细叙述被盗经过及嫌疑人情况。
2. 立案标准：一般而言，盗窃公私财物价值一千元至三千元以上，即可能构成盗窃罪，需要立案追诉。本案中，员工偷金3万元，已远超立案标准，公安机关应依法立案侦查。

二. 侦查及起诉

1. 侦查过程：公安机关立案后，将展开侦查工作，包括收集证据、询问证人、讯问嫌疑人等，以查明案件事实。
2. 起诉阶段：侦查终结后，若认为案件事实清楚，证据确实、充分，公安机关将移送人民检察院审查起诉。人民检察院将依法对案件进行审查，若认为符合起诉条件，将向人民法院提起公诉。

三. 审判及量刑

1. 审判程序：人民法院受理案件后，将依法组成合议庭进行审理。在审判过程中，将充分听取控辩双方的意见，对证据进行质证，并依法作出判决。
2. 量刑依据：根据《中华人民共和国刑法》第二百六十四条，盗窃公私财物，数额较大的，或者多次盗窃、入户盗窃、携带凶器盗窃、扒窃的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。本案中，员工偷金3万元，属于“数额较大”的情形，将面临三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金的刑罚。

我建议：作为受害者或企业负责人，在报警后应积极配合公安机关的侦查工作，提供必要的证据和线索。同时，也要加强内部管理，防范类似事件的再次发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。