一个判决书中有两个被告时，可以分开申请强制执行，但需遵循一定的法律程序和规定。以下是对此问题的详细分析：
一、申请强制执行的基本流程
准备申请材料：
- 强制执行申请书：需详细说明申请执行的事项、理由及两个被告未履行的情况。
- 主体资格证明材料：申请人提供身份证明；两被告的身份信息，若为企业则需提供营业执照副本及法定代表人身份证明。
- 生效法律文书副本：判决书的原件或经法院盖章确认的副本，以及生效证明（如适用）。
向法院提交申请：
- 将准备好的材料提交给一审法院或与一审法院同级的被执行财产所在地法院。
- 法院会对申请材料进行形式审查，确保材料齐全、格式正确。
法院受理与执行措施：
- 法院在符合受理条件的情况下，会立案并向申请人送达受理通知书，同时向两被告发出执行通知书。
- 法院会通过网络执行查控系统等方式，查询两被告名下的各类财产状况。
- 根据查询结果，法院会采取相应的执行措施，如扣划银行账户存款、查封、拍卖资产等。
二、分开申请强制执行的可行性及操作
可行性：
- 在有两个被告的案件中，申请人可以针对每个被告分别提出强制执行申请。这是因为每个被告在判决书中都有各自应履行的义务，申请人有权要求法院对每个被告都采取适当的执行措施。
操作方式：
- 申请人可以在强制执行申请书中明确列出对每个被告的执行请求，并提交相应的证据材料。
- 法院在受理申请后，会分别向两个被告发出执行通知书，并根据各自的财产状况采取相应的执行措施。
- 如果执行财产足以清偿全部债务，法院会按判决书确定的份额进行分配；如果执行财产不足以清偿，法院会根据相关法律规定按比例分配。
三、注意事项与建议
确保全面执行：
- 申请人在申请强制执行时，需确保对每个被告都进行了相应的执行程序，避免遗漏或忽视对某个被告的执行。
关注执行进展：
- 申请人应密切关注执行进展，及时与法院沟通，了解执行情况，并根据需要提供进一步的证据或信息。
提出异议：
- 如果当事人、利害关系人认为执行行为违反法律规定的，可以向负责执行的法院提出书面异议，法院会依法进行裁定。
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