破产企业土地由政府收回后，通常由政府指定的机构或部门进行拍卖。以下是对此问题的详细分析：
一、政府收回土地的法律依据与程序
在破产程序中，若企业拥有的土地使用权因破产清算等原因需要被收回，政府通常会依据相关法律法规（如《中华人民共和国企业破产法》、《中华人民共和国土地管理法》等）进行收回。收回程序一般包括评估土地价值、确定补偿方案、发布收回公告等步骤。
二、拍卖主体的确定
政府指定机构：政府收回土地后，为了确保土地的有效利用和公开、公平、公正的处置，通常会指定一个或多个机构或部门负责土地的拍卖工作。这些机构或部门可能包括国土资源部门、拍卖行、资产处置公司等。
拍卖程序：被指定的机构或部门会按照相关法律法规和程序，组织土地的拍卖活动。这包括发布拍卖公告、接受竞买人报名、组织现场拍卖、确定成交价格等步骤。
三、特殊情况下的拍卖主体
破产管理人参与：在某些情况下，破产管理人可能会在政府收回土地后，参与土地的拍卖工作。但这通常是在政府授权或委托的情况下进行，且破产管理人需遵循相关法律法规和程序。
其他主体参与：除了政府指定的机构或部门外，理论上其他具备拍卖资质的主体也可能参与土地的拍卖工作。但这需要得到政府的授权或委托，并遵循相关法律法规和程序。然而，在实际操作中，这种情况较为罕见。
四、法律建议与风险提示
遵循法律法规：在破产企业土地被政府收回并拍卖的过程中，所有参与方都应严格遵循相关法律法规和程序，确保拍卖活动的合法性和有效性。
关注拍卖公告：对于有意竞买该土地的主体，应密切关注政府或指定机构发布的拍卖公告，了解拍卖时间、地点、竞买条件等信息。
谨慎评估风险：在参与竞买前，竞买人应对土地的价值、用途、规划条件等进行充分评估，并谨慎考虑可能存在的风险（如土地权属纠纷、规划变更等）。
若您在破产企业土地拍卖方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律建议。