非法占用农用地相对不起诉的理由主要包括以下几个方面：

1. 数据准确性问题：

   • 在一些案件中，由于证据无法准确证明土地的破坏面积和性质，或者地块属性不明确，导致检察机关无法确定行为是否达到非法占用标准，或者现有证据不足以证明其推毁面积符合立案标准。例如，张某某非法占用农用地案中，审查发现该地块在张某某破坏前已被取土破坏，无法确定其行为是否达到非法占用标准，且现有证据不足以证明其推毁面积符合立案标准，故决定不起诉。又如，李某某非法占用农用地案中，涉案地块性质不明，无法满足起诉条件，决定不起诉。

2. 证据真实性和关联性不足：

   • 当犯罪事实缺乏足够证据支持，或者证据之间无法形成足够证据链以证实犯罪事实时，检察机关可能会决定不起诉。例如，李某某非法占用农用地案中，经审查发现证据无法充分支撑指控，犯罪事实不清，不符合起诉条件，决定不起诉。董某某非法占用农用地案中，证据不足，且两次补侦仍无法明确其犯罪事实，也决定不起诉。

3. 未达到“数量较大”或“造成农用地大量毁坏”标准：

   • 如果行为人的行为虽然涉及非法占用农用地，但并未达到法律规定的“数量较大”或“造成农用地大量毁坏”的标准，那么检察机关可能会认为不构成犯罪，从而决定不起诉。例如，高某甲非法占用农用地案中，高某甲虽继续实施相关行为，但涉案林地已毁坏，无法再造成新的严重破坏结果，故不构成新的犯罪行为，决定不起诉。刘某某非法占用农用地案中，刘某某改变林地用途但已补种并验收合格，未严重破坏种植条件，故不构成犯罪。

4. 主观要件缺失：

   • 如果行为人缺乏明知土地性质为农用地的主观故意，那么检察机关可能会认为不构成非法占用农用地罪，从而决定不起诉。例如，吴某某非法占用农用地案中，吴某某在不明知土地性质的情况下使用林地，缺乏主观犯罪故意，决定不起诉。

5. 初犯及修复治理：

   • 对于初犯且行为人积极配合整改、修复治理并符合相关政策的案件，检察机关可能会考虑从轻处理，决定不起诉。例如，张某某非法占用农用地案中，张某某涉嫌非法占用农用地，案发后主动认罪并配合整改，符合保护非公企业政策，决定不予起诉。庄某某非法占用农用地案中，庄某某作为法定代表人，在案发后积极配合补植复绿并缴纳相关费用，犯罪情节轻微，且其行为促进地方就业，综合考虑不予起诉。

法律建议：

• 如果您或他人涉嫌非法占用农用地，建议尽快咨询专业律师，了解案件的具体情况和可能的法律后果。
• 在案件处理过程中，应积极配合相关部门的调查和整改工作，争取从轻处理。
• 如果认为自己的行为不构成犯罪或存在其他合理理由，应及时向检察机关提出申诉或辩护意见。

可能的法律后果：

• 如果被检察机关决定起诉并经法院审理认定构成非法占用农用地罪，可能会面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役或罚金等。
• 即使未被起诉或认定构成犯罪，也可能面临行政处罚或其他法律责任。因此，务必遵守相关法律法规，避免非法占用农用地等行为。