此情况下，应首先审查特别代理人的代理权限及调解过程是否存在问题，再根据实际情况决定应对措施。

一. 审查特别代理人的代理权限

1. 代理权限的审查：根据《民事诉讼法》的相关规定，特别代理人需在授权范围内进行代理活动。首先，应查看当事人给予特别代理人的授权委托书，明确其是否有权进行调解及决定赔偿数额。
2. 超越代理权的处理：如果特别代理人超越了授权范围，擅自决定赔偿数额并结案，该行为可能对当事人不产生法律效力。当事人有权要求法院重新审理或采取其他救济措施。

二. 审查调解过程的合法性

1. 调解的自愿性：根据《民事诉讼法》第九十三条，调解需遵循自愿原则。如果特别代理人在未通知当事人的情况下进行调解，可能违反了这一原则。
2. 调解协议的效力：如果调解过程存在瑕疵，如未通知当事人、调解协议内容显失公平等，当事人有权请求法院确认调解协议无效或撤销调解协议。

三. 应对措施

1. 与特别代理人沟通：首先，建议与特别代理人沟通，了解其调解的依据和理由，以及为何未通知当事人。
2. 向法院提出申请：如果确认特别代理人的行为存在问题，当事人可以向法院提出申请，要求重新审理或撤销调解协议。
3. 寻求法律援助：如果当事人对法律程序不熟悉，可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的合法权益得到维护。

四. 结论与建议

• 结论：特别代理人在未通知当事人的情况下进行调解并达成赔偿协议，可能存在问题。当事人应尽快审查代理权限和调解过程的合法性，并采取相应措施维护自己的权益。
• 建议：我建议当事人首先与特别代理人沟通，了解详细情况。如果无法解决问题，应及时向法院提出申请，并考虑寻求专业律师的法律援助。如有进一步需要，您可以继续咨询我。