针对您提出的“行政执法案卷中行政机关领导有不同意见时如何填写案卷”的问题，这是一个涉及行政执法程序规范性和案卷制作严谨性的重要环节。以下是我为您提供的详细解答：

一、理解行政机关领导不同意见的性质

在行政执法过程中，行政机关领导之间或领导与执法人员之间可能会因对案件事实认定、法律适用、处罚幅度等方面存在不同看法而产生意见分歧。这种分歧是正常的，关键在于如何妥善处理并在案卷中准确记录。

二、案卷中记录不同意见的原则

1. 客观性原则：记录不同意见时应保持客观中立，不夸大、不缩小，真实反映各方观点。
2. 完整性原则：应全面记录所有相关意见，包括提出意见的主体、时间、内容及依据。
3. 合法性原则：记录的内容必须符合法律法规和行政执法程序的要求，不得违反法定程序或侵犯当事人合法权益。

三、具体填写方法

1. 在案卷“处理意见”或“讨论记录”部分记录：

   • 明确标注“讨论记录”或“处理意见分歧记录”等标题。
   • 依次记录每位领导或执法人员的意见，包括意见内容、提出时间、提出人姓名及职务。
   • 对于分歧较大的意见，可简要说明分歧点及各方理由。

2. 附上相关会议纪要或讨论记录：

   • 如果行政机关内部就案件处理召开了专门会议，应将会议纪要作为案卷附件。
   • 会议纪要中应详细记录会议时间、地点、参会人员、讨论内容及最终决定。

3. 在“最终处理决定”部分明确：

   • 经过讨论后，应形成最终处理决定，并在案卷中明确记录。
   • 最终处理决定应说明采纳了哪些意见，未采纳哪些意见及理由。

四、注意事项

1. 保持案卷整洁：填写案卷时应使用规范字体、字号，保持页面整洁，避免涂改、污损。
2. 遵守保密规定：涉及国家秘密、商业秘密或个人隐私的内容应按照保密规定处理。
3. 及时归档：案卷制作完成后应及时归档，确保案卷的完整性和安全性。

五、参考案例与规范

虽然您提供的参考信息中并未直接涉及行政机关领导不同意见的填写方法，但从中我们可以汲取到关于行政执法案卷评查的标准和要求，如事实认定、法律适用、程序履行等方面的严谨性。这些要求同样适用于记录行政机关领导不同意见时，应确保记录的准确性和合法性。

综上所述，当行政机关领导在行政执法案卷中有不同意见时，应在案卷的“处理意见”或“讨论记录”部分客观、完整地记录各方意见，并附上相关会议纪要或讨论记录。最终处理决定应明确说明采纳和未采纳的意见及理由。希望这些解答能对您有所帮助。