当图纸在三审过程中出现问题时，处理流程需要严谨且有序，以确保图纸的质量和合规性。以下是一个清晰、详细且有深度的处理建议：

一、问题识别与记录

首先，审查机构应详细记录图纸三审中发现的问题，包括但不限于设计错误、不符合规范、遗漏信息等。这些问题应被明确标注，并附上具体的审查意见和依据，以便后续处理。

二、退回与告知

1. 退回图纸：审查机构应通过施工图数字化审查系统（或其他指定渠道）将图纸退回给建设单位。
2. 出具审查意见告知书：同时，审查机构应出具一份详细的审查意见告知书，明确说明图纸不合格的原因、具体问题点以及需要修改的内容。

三、建设单位响应

1. 接收与确认：建设单位在收到退回的图纸和审查意见告知书后，应仔细核对并确认问题。
2. 要求修改：建设单位应要求原勘察设计单位对图纸进行修改，确保所有问题得到妥善解决。

四、修改与复审

1. 修改图纸：原勘察设计单位应根据审查意见告知书中的要求，对图纸进行修改，并确保修改后的图纸符合所有相关规范和标准。
2. 提交复审：修改完成后，建设单位应将修改后的图纸通过施工图数字化审查系统（或其他指定渠道）送回原审查机构进行复审。

五、复审与反馈

1. 复审过程：审查机构应对修改后的图纸进行再次审查，确保所有问题已得到解决，且图纸符合所有要求。
2. 反馈结果：如果图纸复审合格，审查机构应出具合格证明；如果仍存在问题，审查机构应再次退回图纸，并出具新的审查意见告知书，要求建设单位继续修改。

六、额外建议与参考

• 建设性修改意见：除应当审查的内容外，如果审查机构发现图纸存在其他不符合现行工程建设标准的情况，可以提出建设性修改意见，并记入审查意见告知书中，供勘察设计单位参考。
• 合规性提醒：建设单位应严格遵守相关法规，确保图纸在未经审核或审查不合格的情况下不擅自施工，以免面临行政处罚。根据《建设工程质量管理条例》，施工图设计文件未经审核或者审查不合格擅自施工的，建设单位将面临责令改正和罚款的处罚。

七、持续沟通与协作

在整个处理过程中，建设单位、原勘察设计单位和审查机构之间应保持持续的沟通与协作，确保问题得到及时、有效的解决。

通过遵循上述处理流程，可以确保图纸三审中出现的问题得到妥善处理，从而保障工程的质量和安全性。