当农村合作建房协议无效后，宅基地一方可能承担的责任主要包括财产返还、折价补偿以及损失赔偿，具体责任需根据过错程度和实际情况确定。以下从不同角度为您详细分析：

一、财产返还责任

根据《民法典》的相关规定，合同无效后，因该合同取得的财产，应当予以返还。在农村合作建房协议无效的情况下，宅基地一方如果因协议取得了对方的财产（如建房资金、材料等），则负有返还的义务。同样，如果对方因协议取得了宅基地的使用权或相关权益，也应当予以返还。

举例说明：假设甲与乙签订农村合作建房协议，约定甲提供宅基地，乙出资建房。后协议被认定无效，甲已将宅基地交付乙使用，乙也已投入资金建房。此时，甲应返还乙投入的建房资金（或等值财产），乙应返还宅基地给甲。

二、折价补偿责任

在财产无法返还或没有必要返还的情况下，得到财产的一方应按财产价值进行折价补偿。这通常发生在宅基地上已建有房屋且难以拆除的情况下。

举例说明：继续上述例子，如果乙已在宅基地上建好了房屋，且房屋难以拆除或拆除后价值大幅减损，那么甲在返还乙投入的建房资金时，可能需要根据房屋的实际价值进行折价补偿。

三、损失赔偿责任

如果协议无效给对方造成了损失，过错方需承担赔偿责任。双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。在农村合作建房协议无效的情况下，宅基地一方如果存在过错（如明知不符合转让条件仍签订协议），则可能需要赔偿对方因此遭受的损失。

损失赔偿的考量因素：

1. 直接损失：如建房资金的利息损失、因协议无效导致的额外支出等。
2. 间接损失：如房屋增值部分的损失（但需注意，宅基地使用权的价值变化通常不计入房屋预期价值的损失范围）。
3. 过错程度：根据双方过错的大小，确定各自应承担的赔偿比例。

举例说明：在上述例子中，如果因协议无效导致乙无法继续使用房屋，且房屋市场价值已大幅上涨，乙因此遭受了损失。此时，如果甲存在过错（如未如实告知宅基地的转让限制），则甲可能需要根据过错程度赔偿乙的部分或全部损失。

四、处理方式与建议

1. 协商解决：在协议无效后，双方应首先尝试通过协商解决财产返还、折价补偿和损失赔偿等问题。协商可以更加灵活、高效地解决纠纷。
2. 诉讼解决：如果协商不成，双方可以向法院提起诉讼，由法院根据具体情况做出裁决。在诉讼过程中，双方应提供充分的证据支持自己的主张。

建议：在签订农村合作建房协议前，双方应充分了解相关法律法规和政策规定，确保协议内容合法有效。同时，在协议履行过程中，双方应保留好相关证据，以便在协议无效时能够维护自己的合法权益。

如果您在农村合作建房协议无效后遇到宅基地一方的责任问题，或者有其他相关法律问题，欢迎直接向我咨询。