工程竣工结算中是否会体现过程性罚款，需结合合同约定、罚款性质及结算规则综合判断，具体分以下两种情况：
1. 合同明确约定罚款条款且符合法定要求时，会体现
若工程合同中明确约定了过程性罚款（如工期延误罚款、质量不达标罚款、安全违规罚款等），且条款内容符合《民法典》关于合同效力的规定（如不违反法律强制性规定、不显失公平），则竣工结算时需按合同约定扣除相应罚款。
法律依据：
- 《民法典》第509条：当事人应按约定全面履行义务，包括合同中的罚款条款。
- 《民法典》第153条：违反法律、行政法规强制性规定的合同条款无效，但过程性罚款若不涉及公共利益或强制性规范（如未违反建筑法、安全生产法等），通常有效。
实务要点：
- 罚款需有明确依据（如合同条款、监理签发的整改通知等）；
- 罚款金额需合理，不得超过合同总价或实际损失的合理范围（否则可能被认定为“违约金过高”而调整）；
- 结算时需附罚款依据（如罚款通知单、签字确认单等），避免争议。
2. 合同未约定或条款无效时，可能不体现
若合同未约定过程性罚款，或罚款条款因以下原因无效，则竣工结算时无需扣除：
- 条款显失公平：如罚款金额远超实际损失（如按日计罚但未约定上限）；
- 违反强制性规定：如罚款涉及“以罚代管”或剥夺承包人基本权利；
- 未履行告知程序：如发包人未在过程中书面通知承包人罚款事项，结算时单方扣除可能被认定为违约。
实务要点：
- 承包人可主张“未收到罚款通知”或“罚款无依据”而拒绝扣除；
- 若发包人强行扣除，承包人可通过协商、诉讼或仲裁要求返还。
总结建议
- 审查合同：重点查看“违约责任”“罚款条款”是否明确、合法；
- 留存证据：过程中及时签收罚款通知，避免结算时被动；
- 协商优先：若对罚款有异议，优先通过补充协议明确，减少纠纷。
如有具体合同条款或结算争议，可进一步提供细节，我将为您详细分析。