若法人代表不配合起诉，可采取以下措施：

一、协商沟通

首先，尝试与法人代表进行深入的协商沟通。了解其不配合的具体原因，是否是因为对起诉事项存在误解或担忧。通过诚挚的交谈和合理的劝说，尝试解决其顾虑，促使其同意并积极配合起诉过程。协商是解决此类问题的首选方式，有助于维护公司内部的和谐与稳定。

二、内部决策程序

若协商无果，可考虑通过公司内部决策程序来解决问题：

1. 召开股东会或股东大会：根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，股东会或股东大会有权决定公司的重大事项，包括更换法人代表。若法人代表不配合起诉，且其行为可能损害公司利益，可召开股东会或股东大会，以三分之二以上表决权通过决议，罢免原法人代表，并选举新任法人代表。
2. 签署股东会决定书：在成功罢免原法人代表后，应立即召集股东会并由相关股东签署股东会决定书，明确新任法人代表的选举结果及职责。
3. 办理变更登记：填写变更法定代表人相关申请表格，并请新任法人代表签字确认。随后，携带公司相关证件前往工商局提交变更申请，完成法人代表的变更登记。

三、法律途径

若法人代表仍然拒绝配合，且其行为已经严重影响到公司的正常运营和起诉进程，可考虑通过法律途径来解决问题：

1. 提起诉讼：依据相关法律规定，向法院提起诉讼，请求强制执行法人代表的变更手续或要求其履行配合起诉的义务。在诉讼过程中，需提供充分的证据证明法人代表的不配合行为及其对公司造成的损害。
2. 申请强制执行：若法院判决支持公司的诉求，但法人代表仍然拒绝履行义务，可向法院申请强制执行。法院将依法采取强制措施，确保判决得到有效执行。

四、注意事项

1. 保留证据：在整个过程中，务必保留好与法人代表协商沟通的记录、股东会或股东大会的决议文件、变更登记的申请材料等相关证据。这些证据将在后续的法律程序中发挥重要作用。
2. 遵守法律程序：在采取任何措施时，都应严格遵守法律程序和相关规定。避免因程序不当或违法操作而引发新的法律纠纷。
3. 寻求专业法律支持：鉴于此类问题的复杂性和敏感性，建议寻求专业律师的法律支持。律师将能够提供全面的法律分析和建议，帮助公司制定合理的解决方案并维护其合法权益。

若您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律支持，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供针对性的法律建议和解决方案。