竣工后打款给其关联公司且法人为同一人，是否违规需分情况讨论：

1. 若合同中有明确约定：

   • 如果建设工程合同中明确规定了付款方式、付款对象，并且明确指出款项应支付给特定的公司或账户，那么在竣工后将款项支付给关联公司，即使法人为同一人，也可能构成违约。因为这种支付方式违反了合同中的明确约定，可能给发包方带来风险，如关联公司可能不具备相应的财务能力或信用，导致款项无法及时、足额地支付给实际施工方或材料供应商等。

2. 若合同中无明确约定，但存在其他违规情形：

   • 如果合同中没有明确规定付款对象，但打款行为存在其他违规情形，如通过关联交易进行利益输送、逃避税收监管等，那么这种行为也可能被视为违规。例如，如果关联公司之间的交易价格明显不合理，低于或高于市场价格，就可能构成利益输送，损害国家或其他利益相关方的利益。
   • 此外，如果打款行为导致工程款被挪用，无法及时支付给实际施工方或材料供应商，影响工程进度或质量，那么这种行为也可能被视为违规，并可能承担相应的法律责任。

3. 若合同中无明确约定，且打款行为合法合规：

   • 如果合同中没有明确规定付款对象，且打款行为本身合法合规，没有违反任何法律法规或合同条款，那么这种行为通常不被视为违规。例如，如果关联公司具备相应的财务能力和信用，且打款行为是为了方便资金管理或提高资金使用效率，那么这种行为就是合法的。

法律建议：

• 在进行建设工程时，建议各方在合同中明确约定付款方式、付款对象等关键条款，以避免后续产生纠纷。
• 如果确实需要将款项支付给关联公司，建议事先与发包方进行充分沟通，并取得其书面同意。
• 同时，应确保关联公司具备相应的财务能力和信用，以避免因关联公司问题而给发包方带来风险。

可能后果：

• 如果打款行为被认定为违规，可能面临合同违约责任、行政处罚甚至刑事责任等后果。
• 合同违约责任可能包括赔偿损失、支付违约金等。
• 行政处罚可能包括罚款、没收违法所得等。
• 如果打款行为涉及犯罪，如挪用资金罪、职务侵占罪等，还可能面临刑事责任。

因此，在进行建设工程时，务必遵守相关法律法规和合同条款，确保打款行为的合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。