在行政处罚案件因当事人不配合终止调查后，扣押物品的处理需依据法定程序和原则进行，具体处理方式如下：

1. 解除扣押并返还物品
   根据《行政强制法》第二十八条，行政机关在调查终结后，若未发现违法行为或违法行为情节显著轻微，应当及时解除扣押措施，并将扣押物品返还当事人。若案件因当事人不配合而终止调查，且无证据证明其存在违法行为，行政机关无权继续扣押物品，必须依法返还。
   例外情形：若扣押物品属于涉案证据且需进一步鉴定（如毒品、假冒商品等），行政机关可暂缓返还，但需在法定期限内（通常为30日）作出处理决定，逾期未处理的，当事人有权要求返还。

2. 依法处置涉案物品
   若扣押物品属于违法所得或违禁品（如赌博工具、非法出版物等），行政机关可依据《行政处罚法》第五十六条，在终止调查后依法予以没收、销毁或采取其他法定处置措施。但需注意：

   • 处置前需履行法定程序，如制作《涉案物品处理清单》，并通知当事人到场（若当事人拒绝到场，可邀请见证人签字）；
     
   • 处置过程需全程记录，确保程序合法性。

3. 当事人不配合的法律后果
   当事人不配合调查（如拒绝接受询问、拒不提供证据等）本身不构成行政机关继续扣押物品的合法理由。行政机关不得以“当事人不配合”为由无限期扣押物品，否则可能构成程序违法。但需注意：

   • 若当事人故意隐匿、毁损证据导致调查无法进行，行政机关可依据《行政处罚法》第五十四条，将相关情况作为“证据不足”的认定依据，但仍需解除扣押；
     
   • 若当事人行为涉嫌妨碍公务，行政机关可依法移送公安机关追究刑事责任，但这与扣押物品的处理无直接关联。

实务建议：

• 行政机关应严格区分“调查终止”与“物品处置”的法律依据，避免以调查终止为由拖延返还物品；
  
• 当事人若认为扣押行为违法，可依据《行政复议法》或《行政诉讼法》申请复议或提起诉讼，要求确认扣押行为违法并赔偿损失。
  

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