占水田建房违反了《中华人民共和国土地管理法》以及《中华人民共和国刑法》（如涉及非法占用农用地罪）的相关规定。以下是对此问题的详细分析：
一、违反《中华人民共和国土地管理法》
土地用途管制制度：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》第四条，国家实行土地用途管制制度。使用土地的单位和个人必须严格按照土地利用总体规划确定的用途使用土地。水田作为农用地，主要用于农业生产，未经批准不得擅自改变用途用于建房等非农业建设。
非法占地行为的法律责任：
- 依据《中华人民共和国土地管理法》第七十七条，未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状。
- 对非法占用土地单位的直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
二、可能涉及《中华人民共和国刑法》的非法占用农用地罪
非法占用农用地罪的构成：
- 如果占水田建房的行为情节严重，即非法占用并毁坏了大量水田，可能构成《中华人民共和国刑法》第三百四十二条规定的非法占用农用地罪。该罪要求行为人违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏。
法律责任：
- 犯非法占用农用地罪的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。这意味着，如果占水田建房的行为达到犯罪程度，行为人将面临刑事处罚。
三、实际案例与法律后果
- 在实际案例中，非法占用水田建房的行为往往受到严厉打击。例如，某地曾发生一起非法占用水田建房的案件，涉案人员因非法占用农用地罪被判处有期徒刑，并处以罚金。同时，其非法建造的房屋也被依法拆除，土地恢复了原状。
四、建议与措施
遵守法律法规：
- 在使用土地时，务必遵守相关法律法规，不得擅自改变土地用途。如需建房，应依法申请并获得相应的土地使用许可。
及时咨询与处理：
- 如果已经占用了水田建房，建议立即停止违法行为，并咨询专业律师或当地自然资源主管部门，了解如何依法处理和纠正错误。
积极配合调查与整改：
- 如果相关部门已经介入调查，应积极配合调查工作，并按照要求进行整改。这有助于减轻法律责任，并避免更严重的后果。
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