农民工工资被扣后，可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 与用人单位协商：

   • 农民工首先可以尝试与用人单位进行直接沟通，了解工资被扣的具体原因，并寻求解决方案。如果双方能够达成一致，可以签订书面协议，明确工资支付的时间和方式。

2. 向劳动监察部门投诉：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位未按时足额支付劳动报酬的，劳动者有权向劳动监察部门投诉。
   • 投诉时，农民工应提供相关证据，如工资条、劳动合同、工作记录等，以证明用人单位存在拖欠工资的行为。
   • 劳动监察部门在接到投诉后，会进行调查核实，并责令用人单位限期支付拖欠的工资。

3. 申请劳动仲裁：

   • 如果与用人单位协商无果，或者用人单位拒绝支付拖欠的工资，农民工可以向有管辖权的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
   • 仲裁过程中，农民工需要提供充分的证据来证明自己的主张，如工资支付记录、劳动合同、工作证明等。
   • 仲裁庭将依法进行审理，并作出裁决。如果用人单位不履行裁决，农民工可以向人民法院申请强制执行。

4. 提起诉讼：

   • 如果农民工对仲裁裁决不服，可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。
   • 人民法院将依法进行审理，并作出判决。判决生效后，如果用人单位仍不履行支付工资的义务，农民工可以申请强制执行。

5. 寻求法律援助：

   • 如果农民工在维权过程中遇到困难，或者经济条件有限无法承担律师费用，可以寻求法律援助机构的帮助。
   • 法律援助机构会为符合条件的农民工提供免费的法律咨询和代理服务，帮助他们维护自己的合法权益。

6. 注意保留证据：

   • 在整个维权过程中，农民工应注意保留相关证据，如工资条、劳动合同、工作记录、沟通记录等。
   • 这些证据将在协商、投诉、仲裁和诉讼过程中发挥重要作用，有助于证明农民工的主张和权益。

可能面临的法律后果：

• 如果用人单位存在拖欠工资的行为，且经劳动监察部门责令限期支付后仍不支付的，可能会面临罚款等行政处罚。
• 如果用人单位的行为构成拒不支付劳动报酬罪，还可能面临刑事追责。

建议：

• 农民工在遇到工资被扣的情况时，应保持冷静，通过合法途径来维护自己的权益。
• 在维权过程中，要注意保留相关证据，并寻求专业律师或法律援助机构的帮助。
• 同时，也要了解自己的权利和义务，遵守法律法规，以合法的方式表达自己的诉求。

如果有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。