医疗事故鉴定双方同意但超了年限，仍有可能进行鉴定，但存在一定限制和条件。以下从不同角度为您详细分析：

法律规定层面

《医疗事故处理条例》等相关法律法规并未明确规定医疗损害鉴定的绝对时间限制。不过，通常情况下，超过一定时间可能会给鉴定工作带来困难，比如病历资料的完整性可能受到影响，患者病情也可能发生变化，这些因素都可能对鉴定结果的准确性和公正性产生不利影响。

实际操作层面

在实践中，超过年限后进行医疗事故鉴定需要综合考虑多种因素：

1. 合理原因：如果患者能够提供充分的证据证明其在规定年限内无法进行鉴定的合理原因，如病情复杂需要进一步治疗、医疗机构未及时告知鉴定权利等，法院或相关鉴定机构可能会准许进行鉴定。
2. 病历资料完整性：鉴定机构会根据病历资料的保存情况来评估是否能够进行鉴定。如果病历资料保存完整，且能够通过现有资料进行客观、准确的分析和判断，鉴定机构可能会受理鉴定申请。

特殊情形考量

1. 不可抗力因素：若患者在规定年限内因不可抗力（如自然灾害、战争等）或其他正当理由无法提出鉴定申请，自障碍消除之日起一定期限内（通常为1年）可以申请鉴定。
2. 医疗机构过错：如果医疗机构故意隐藏或拒绝提供与医疗纠纷有关的病历资料，导致无法进行鉴定，那么可以推定医疗机构存在过错，并且这种情况下可能不受通常年限的限制。但这一推定需要充分的证据支持。

法律建议

1. 及时沟通：如果双方同意进行医疗事故鉴定但已超年限，建议及时与相关鉴定机构或法院沟通，说明情况并咨询是否可以受理。
2. 收集证据：尽可能收集和保存与医疗事故相关的所有证据，包括病历资料、诊断证明、治疗记录等，以备鉴定之需。
3. 寻求专业帮助：由于医疗事故鉴定涉及复杂的法律和医学知识，建议寻求专业律师或医学专家的帮助，以确保您的权益得到充分保障。

举例说明：假设一位患者在医疗事故发生后两年才意识到需要鉴定，但由于当时病情严重且持续治疗，无法及时提出申请。若患者能提供充分的医疗记录证明其治疗过程和病情变化，以及因治疗无法及时申请鉴定的合理原因，那么在与医疗机构和鉴定机构沟通后，仍有可能被受理进行鉴定。

总之，医疗事故鉴定双方同意但超了年限，能否进行鉴定并非绝对，需要根据具体情况进行综合判断。如果您正面临此类问题，建议直接向我咨询，以便获得更具体和专业的法律建议。