针对行政案件当事人对同一标的的争议涉及多个行政主体纠纷的处理，核心结论在于需根据具体情况，通过法律途径明确各行政主体的责任，并协调解决争议。以下从不同角度进行详细分析：
一、法律程序上的处理
行政复议：
- 若当事人对多个行政主体的具体行政行为均不服，可以分别向有管辖权的行政复议机关申请行政复议。行政复议机关将依法对各行政主体的行为进行审查，并作出复议决定。
- 在复议过程中，若发现各行政主体之间存在职责不清或相互推诿的情况，复议机关可以协调相关行政主体，明确各自职责，共同解决争议。
行政诉讼：
- 当事人若对行政复议结果不满，或认为多个行政主体的行为均侵犯了其合法权益，可以向人民法院提起行政诉讼。
- 在诉讼过程中，法院将依法对各行政主体的行为进行审查，判断其合法性，并作出判决。若涉及多个行政主体，法院可能会根据案件需要，追加相关行政主体为共同被告或第三人，以便全面审查案件事实。
二、实体责任上的划分
明确各行政主体的职责：
- 在处理涉及多个行政主体的行政案件时，首先需要明确各行政主体的职责范围。这通常需要根据相关法律法规、规章以及行政机关的“三定方案”（即定职能、定机构、定编制）来确定。
- 若各行政主体之间存在职责交叉或重叠的情况，需要依据相关法律规定或行政协议来划分责任。
协调解决争议：
- 在明确各行政主体职责的基础上，需要协调各行政主体共同解决争议。这可以通过召开协调会、制定协调方案等方式实现。
- 若各行政主体之间无法达成一致意见，可以报请共同的上级行政机关进行协调或裁决。
三、特殊情况的处理
共同行为或关联行为：
- 若多个行政主体的行为构成共同行为或关联行为，且该行为侵犯了当事人的合法权益，当事人可以一并提起行政复议或行政诉讼，要求各行政主体共同承担责任。
- 在这种情况下，复议机关或法院将依法对各行政主体的行为进行整体审查，并作出相应的复议决定或判决。
行政赔偿：
- 若当事人的合法权益因多个行政主体的违法行为而受到损害，且无法通过行政复议或行政诉讼得到充分救济，当事人可以依法提起行政赔偿诉讼。
- 在行政赔偿诉讼中，法院将依法判断各行政主体的赔偿责任，并作出赔偿判决。若涉及多个行政主体，法院可能会根据各行政主体的过错程度、行为与损害结果之间的因果关系等因素，划分各自的赔偿责任。
四、实际操作中的建议
- 收集证据：当事人应充分收集与案件相关的证据材料，包括行政机关作出的具体行政行为、相关法律法规、规章以及行政协议等，以便在行政复议或行政诉讼中证明自己的主张。
- 咨询专业律师：由于涉及多个行政主体的行政案件往往较为复杂，当事人可以咨询专业律师，以便更好地了解自己的权利义务和诉讼风险，制定合理的诉讼策略。
有问题可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况，提供更为详细的法律建议。