针对您提出的“违纪案件如何认定重复检举控告”的问题，以下是根据相关法规及实践操作给出的详细解答：
一、重复检举控告的判定标准
根据《纪检监察机关处理检举控告工作规则》及相关实践，重复检举控告的判定主要基于与已接收举报的比对，具体情形包括：
被反映人、反映人和反映内容均相同：即举报对象、举报人以及举报的具体内容都与之前接收的举报完全一致。
被反映人、反映人相同，反映内容实质相同且无新反映事项：虽然举报内容在表述上可能有所差异，但核心事实、关键情节等实质内容相同，且没有提出新的举报事项。
匿名举报中，被反映人相同、反映内容实质相同且无新反映事项：对于匿名举报，如果被举报对象相同，且举报内容在实质上一致，没有新增的举报内容，也视为重复检举控告。
若不属于上述情形，但承办人经研判认为属于重复检举控告的，应当提出书面意见，并履行审批手续后，按照批示意见办理。
二、重复检举控告的时间限制
重复检举控告的判定不受举报时间的限制。无论举报是何时提出的，只要符合上述判定标准，即可视为重复检举控告。
三、重复检举控告的判定衔接工作
本级自收件的重复判定：信访举报部门按照管理权限，对本级自收件进行重复判定。
下级报送件及其他部门移交件的判定：对下级报送件以及其他部门和单位移交的举报件，也按照本级自收件办理并进行重复判定。
上级转送件的判定：对上级转送件，可以与本级自收件进行重复判定，但不改变上级对该件的判定。
四、跨渠道举报件的重复判定
对于通过来信、来访、来电、网络等不同渠道受理的举报，可以采用自动检索、人工比对等方式进行跨渠道重复判定，以确保判定的准确性和全面性。
五、重复检举控告的办理办法
登记与保管：市、县（区）信访室以及相关部门应当在检举举报平台进行重复件判定后，由专人负责对原信（网络、电话重复检举控告原信无需打印）进行统一登记、集中保管、留存备查。
留存期限：留存期限为1年，期满后在经本机关分管领导批准后，可以按照涉密文件销毁要求进行集中销毁。
通报制度：信访室应当每季度向案件监督管理、监督检查等部门书面通报登记情况，通报内容截止日期为该季度第三个月的25日，以确保信息的及时传递和共享。
综上所述，重复检举控告的判定是一个严谨而细致的过程，需要依据明确的判定标准、不受时间限制的原则、以及跨渠道的比对方法来进行。同时，对于判定为重复检举控告的举报件，也有着严格的登记、保管和通报制度。希望以上解答能够对您有所帮助。