断绝母女关系协议书，无论亲妹是否作为公证人，该协议本身都是无法进行公证的，因为血缘关系无法通过法律手段断绝。以下从几个方面进行详细分析：
一、血缘关系的法律特性
血缘关系，如母女关系，是基于出生而自然形成的，具有法律上的强制性和不可选择性。这种关系不受个人意志的转移而改变，也无法通过协议或公证等方式来断绝。法律上，父母对子女有抚养的义务，子女对父母有赡养的义务，这些义务是法定的，不因任何协议或行为而免除。
二、公证的适用范围
公证是公证机构根据自然人、法人或者其他组织的申请，依照法定程序对民事法律行为、有法律意义的事实和文书的真实性、合法性予以证明的活动。然而，公证并不适用于所有情况，特别是那些违反法律强制性规定或社会公共道德的行为。断绝母女关系协议书，由于违反了法律关于血缘关系不可断绝的规定，因此无法进行公证。
三、亲妹作为公证人的问题
即使亲妹愿意作为公证人，也无法改变断绝母女关系协议书无法公证的事实。因为公证的有效性并不取决于公证人的身份，而是取决于公证事项本身的合法性和真实性。在这个案例中，断绝母女关系协议书本身就不合法，因此无论谁作为公证人，都无法使其具有法律效力。
四、可能的法律后果
如果尝试通过非法律手段（如私下协议）来断绝母女关系，可能会面临一系列法律后果。例如，如果父母未履行抚养义务，子女有权要求父母履行；同样，如果子女未履行赡养义务，父母也有权要求子女履行。此外，这种私下协议还可能引发家庭纠纷，甚至导致法律诉讼。
五、建议与指导
总结来说，断绝母女关系协议书无法进行公证，因为血缘关系无法通过法律手段断绝。如果有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。