在工程合同中约定结算二审程序时，需要确保条款内容既符合法律法规的要求，又能清晰、明确地界定双方的权利与义务。以下是一个关于如何在工程合同中约定结算二审程序的详细建议：

一、引言与目的

在合同开头部分，应明确阐述结算二审程序的目的，即为了确保工程结算的准确性、公正性和合法性，通过二审程序对一审结算结果进行复核和纠错。

二、二审程序的启动条件

1. 一审结算完成：明确一审结算工作完成后，若任何一方对结算结果有异议，可启动二审程序。
2. 异议提出：规定异议方应在收到一审结算报告后的一定期限内（如15个工作日），以书面形式向另一方提出二审申请，并附上详细的异议理由和证据。

三、二审机构的选定

1. 双方协商：首先尝试由双方协商选定一个具有资质和经验的第三方机构进行二审。
2. 指定机构：若协商不成，可约定由某个公认的权威机构（如行业协会、仲裁机构等）指定二审机构。
3. 机构资质：明确二审机构应具备的资质条件，如具有相应的工程造价咨询资质、丰富的工程结算经验等。

四、二审程序的具体步骤

1. 提交资料：异议方应向二审机构提交一审结算报告、异议书及相关证据材料。
2. 审查与复核：二审机构应对提交的资料进行审查，必要时可进行现场勘查或要求双方补充资料。
3. 出具二审报告：二审机构应在规定期限内（如30个工作日）出具二审报告，明确二审结果及理由。

五、二审结果的效力与执行

1. 结果确认：双方应认可二审报告的结果，并作为最终结算的依据。
2. 执行与支付：根据二审结果，双方应及时完成结算款的支付或退还工作。
3. 争议解决：若对二审结果仍有争议，可约定通过仲裁或诉讼等法律途径解决。

六、其他条款

1. 费用承担：明确二审程序的费用（如二审机构的服务费）由哪方承担，或按比例分担。
2. 保密条款：规定双方及二审机构应对结算过程中涉及的商业秘密和敏感信息予以保密。
3. 合同变更与解除：若二审程序导致原合同价款发生重大变更，可约定合同变更或解除的条件和程序。

示例条款

“双方同意，在一审结算完成后，若任何一方对结算结果有异议，可在收到一审结算报告后15个工作日内以书面形式向另一方提出二审申请。二审机构由双方协商选定，若协商不成，则由[指定机构]指定。二审机构应具备相应的工程造价咨询资质，并在收到资料后30个工作日内出具二审报告。双方应认可二审报告的结果，并作为最终结算的依据。二审程序的费用由[约定承担方]承担。”

通过以上条款的设置，可以确保工程合同中的结算二审程序既合法合规，又能有效保障双方的权益。