针对您提出的问题，即欠您公司项目款的水厂被收购后，项目款是否还能要回来，我的结论是：这取决于多个因素，但通常情况下，您公司的债权不会因水厂被收购而自动消灭，您仍有权追讨欠款。 以下是我从不同角度为您进行的分析：
债权转让与债务承担：
- 当水厂被收购时，其资产和负债通常会一并转让给收购方。这意味着，如果收购协议中明确规定了原水厂的债务由收购方承担，那么您公司有权向收购方追讨欠款。
- 如果收购协议中没有明确规定债务承担问题，或者规定原水厂的债务仍由原水厂（或其原股东）承担，那么您公司可能需要向原水厂或其原股东追讨欠款。但在此情况下，由于水厂已被收购，其原股东可能已发生变化，追讨难度可能会增加。
合同相对性原则：
- 根据合同相对性原则，您公司与水厂之间的项目合同仅对双方具有约束力。因此，无论水厂是否被收购，您公司都有权基于合同关系向水厂（或其债务承担者）追讨欠款。
- 如果水厂被收购后，收购方以新的主体身份与您公司进行交易或确认债务，那么您公司也可以基于新的交易关系或债务确认文件向收购方追讨欠款。
法律程序与救济措施：
- 如果水厂或收购方拒绝支付欠款，您公司可以通过法律途径追讨。这包括向法院提起诉讼、申请仲裁或采取其他法律救济措施。
- 在诉讼或仲裁过程中，您公司需要提供充分的证据证明水厂（或其债务承担者）存在欠款行为，并证明欠款金额和期限等关键事实。
实际操作中的注意事项：
- 在追讨欠款前，建议您公司先对水厂的收购情况进行详细了解，包括收购协议的内容、债务承担情况等。这有助于您公司确定追讨对象和追讨策略。
- 如果可能的话，建议您公司尝试与收购方进行协商，看是否能够达成还款协议或债务重组方案。这有助于降低追讨成本和时间成本。
- 如果协商无果或收购方拒绝承担债务，那么您公司应及时采取法律措施追讨欠款，以免错过诉讼时效或其他法律救济期限。
法律建议：
- 建议您公司尽快收集与水厂之间的项目合同、交易记录、欠款确认文件等证据材料，以便在追讨欠款时提供充分的证明。
- 如果您公司对水厂的收购情况不了解或无法确定债务承担者，可以考虑聘请专业律师进行调查和取证工作。
- 在追讨欠款过程中，建议您公司保持与收购方或原水厂的沟通渠道畅通，以便及时了解债务承担情况和还款进展。
可能面临的法律后果：
- 如果您公司成功追讨到欠款，那么将能够收回项目款并维护自身合法权益。
- 如果您公司未能及时追讨到欠款或追讨无果，那么可能会面临资金损失和商业信誉受损等风险。因此，建议您公司及时采取法律措施追讨欠款。
如果您在此过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。