大股东在没有通知法人且明知公章没有丢失和被盗的情况下把公章挂失，这一行为通常是不合法的。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、公司治理与内部管理角度
公司章程与内部规定：
- 公司章程或内部管理规定可能明确规定了公章的使用、保管和挂失程序。大股东未经法定程序或违反公司章程规定擅自挂失公章，可能构成对公司内部管理秩序的破坏。
- 若公司章程或内部规定要求挂失公章需经法人同意或通知法人，那么大股东的行为显然违反了这些规定。
法人地位与职责：
- 法人是公司的法律代表，负责对外代表公司进行民事活动。公章作为公司的重要法律文件签署工具，其挂失应通知法人，以确保法人能够及时了解并处理相关事宜。
- 大股东未经通知法人擅自挂失公章，可能干扰了法人的正常职责履行，损害了公司的利益。
二、法律责任角度
民事责任：
- 大股东擅自挂失公章可能给公司造成经济损失，如因公章挂失导致的合同违约、诉讼纠纷等。在此情况下，大股东可能需要承担赔偿责任。
- 若大股东的行为构成对公司财产的侵占或滥用，还可能面临其他民事责任。
行政责任：
- 如果大股东的行为违反了相关行政法规或规章，如公司登记管理条例等，可能面临行政处罚，如罚款、责令改正等。
刑事责任：
- 在极端情况下，如果大股东的行为构成犯罪，如伪造公司印章罪、职务侵占罪等，将面临刑事追究。
三、实际操作与建议
核实挂失原因与程序：
- 首先应核实大股东挂失公章的具体原因和程序是否合法合规。如果挂失程序存在瑕疵或违反公司章程规定，公司可以要求大股东撤销挂失或采取其他补救措施。
加强内部管理：
- 公司应完善内部管理制度，明确公章的使用、保管和挂失程序，并加强对大股东等关键人员的监督和管理，防止类似事件再次发生。
寻求法律救济：
- 如果大股东的行为给公司造成了实际损失，公司可以依法向大股东追究民事责任。同时，如果涉及行政违法或犯罪行为，公司还可以向相关行政部门或司法机关报案或举报。
建议：作为公司的一员或相关利益方，如果发现大股东存在擅自挂失公章等不当行为，应及时与公司管理层沟通并寻求法律帮助。同时，公司也应加强内部管理，完善相关制度，以防范类似风险的发生。如果有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。