分居三年且在此期间与他人生育孩子，在起诉离婚开庭时，通常可以作为感情破裂的证据。以下从不同角度为你详细分析：

法律角度

根据我国相关法律规定及司法实践，夫妻因感情不和分居满二年，且在分居期间与他人同居并生育子女，这通常会被视为夫妻感情确已破裂的情形。在诉讼离婚过程中，法院会综合考虑多种因素来判断夫妻感情是否破裂，其中分居时间以及分居期间的行为是重要的考量因素。你提到的分居三年且与他人生育孩子的情况，符合法律上认定感情破裂的典型情形，因此可以作为感情破裂的有力证据。

证据收集与提交角度

在起诉离婚时，为了支持自己的诉求，你需要准备并提交相关证据。这些证据可以包括但不限于：

• 分居证明：如租房合同、水电费缴纳记录、社区或物业出具的居住证明等，用以证明双方确实处于分居状态且已满一定时间。
• 孩子出生证明：如果与他人生育了孩子，孩子的出生证明可以作为分居期间行为的一个佐证，进一步证明双方感情已经破裂。
• 其他证据：如聊天记录、通话录音、证人证言等，用以证明双方在分居期间没有和好的可能，且感情已经彻底破裂。

在提交证据时，你需要确保证据的真实性、合法性和关联性。法院会根据你提交的证据，结合双方的陈述和辩论，来综合判断夫妻感情是否破裂。

法院判决角度

如果法院认定夫妻感情确已破裂，且调解无效，那么法院会判决离婚。在判决离婚时，法院还会对子女抚养、财产分割等问题进行一并处理。对于子女抚养问题，法院会根据子女的年龄和双方抚养条件等，遵循最有利于未成年子女的原则进行判决。对于财产分割问题，法院会依照法律规定，遵循照顾子女、女方和无过错方权益的原则进行。

特殊情况与注意事项

虽然分居三年且与他人生育孩子通常可以作为感情破裂的证据，但也需要考虑一些特殊情况。例如，如果对方能够证明分居期间双方仍有联系，且存在和好的可能，或者能够证明你与他人生育孩子的行为存在其他合理原因（如被欺骗、被胁迫等），那么法院可能会对感情破裂的认定持谨慎态度。

建议：

• 在起诉离婚前，尽量收集并保存好相关证据，确保证据的充分性和有效性。
• 在诉讼过程中，积极配合法院的调查和调解工作，如实陈述事实和提供证据。
• 如果对法律程序或证据收集等方面存在疑问或不确定，可以及时向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。