当应急部门要对您的企业进行罚款时，您可以按照以下步骤来应对：
一、了解处罚依据与事实
首先，您需要明确应急部门对您企业进行处罚的具体依据和事实。这通常包括：
法律法规：如《中华人民共和国安全生产法》、《中华人民共和国消防法》、《中华人民共和国突发事件应对法》等，这些法律明确规定了企业在安全生产、消防安全、突发事件应对等方面的责任和义务。
违法事实：应急部门会指出您企业存在的具体违法行为，如未设置安全生产管理机构、未配备安全生产管理人员、未对从业人员进行安全生产教育和培训、消防设施不符合标准、占用疏散通道、在突发事件应对中未制定预案或未及时采取措施等。
二、评估处罚的合法性与合理性
在了解处罚依据与事实后，您需要评估处罚的合法性与合理性：
合法性：检查应急部门是否遵循了法定程序进行处罚，包括调查取证、听证（如适用）、告知权利、作出处罚决定等环节。
合理性：根据违法事实的性质、情节、社会危害程度等因素，评估处罚金额是否合理。处罚金额通常根据违法的事实、性质、手段、后果、情节等因素在规定的行政处罚种类和幅度内进行裁量。
三、采取应对措施
根据评估结果，您可以采取以下应对措施：
配合调查：积极配合应急部门的调查工作，提供必要的资料和证据。
陈述申辩：如果您认为处罚不当或存在误解，可以在收到处罚决定书前向应急部门提出陈述申辩，说明您的观点和理由。
申请听证：如果处罚决定涉及重大行政处罚（如责令停产停业整顿、责令停产停业、吊销有关许可证、撤销有关执业资格、岗位证书，或者对公民处以2万元以上的罚款，对法人或者其它组织处以5万元以上的罚款等），您有权要求举行听证。在听证过程中，您可以进一步阐述您的观点和理由。
行政复议或行政诉讼：如果您对处罚决定不服，可以在收到处罚决定书之日起六十日内申请行政复议或者六个月内直接依法向人民法院提起行政诉讼。
四、加强内部管理
为了避免类似情况再次发生，您需要加强企业的内部管理：
完善制度：建立健全安全生产、消防安全、突发事件应对等方面的管理制度和操作规程。
加强培训：定期对从业人员进行安全生产教育和培训，提高他们的安全意识和操作技能。
定期检查：定期对企业的安全生产、消防安全等方面进行检查，及时发现并消除安全隐患。
五、寻求专业帮助
如果您在应对过程中遇到困难或不确定如何处理，可以寻求专业律师或咨询机构的帮助。他们可以提供专业的法律意见和指导，帮助您更好地应对处罚并维护企业的合法权益。
总之，当应急部门要对您的企业进行罚款时，您需要保持冷静、了解处罚依据与事实、评估处罚的合法性与合理性、采取应对措施、加强内部管理并寻求专业帮助。这样，您才能更好地应对处罚并维护企业的合法权益。