股东会没有按董事会通过的决议修改章程，这一行为是否违法，需结合具体情况分析，以下从不同角度进行阐述：
一、决议内容与程序的合法性审查
决议内容合法性：
- 若董事会通过的决议内容本身违反法律、行政法规的强制性规定，那么股东会拒绝按此决议修改章程，反而是遵守法律的表现，不构成违法。
- 若决议内容合法，但股东会未予采纳，则需进一步审查股东会的决策程序。
决策程序合法性：
- 根据《中华人民共和国公司法》及相关规定，对公司章程的修订需经过股东会议或股东大会的特别决议，通常要求至少有三分之二以上拥有表决权的股东投赞成票方可生效。
- 若股东会未按照法定程序（如未达到法定的表决权比例）进行决策，导致未能按董事会决议修改章程，则此行为可能构成程序违法。
二、股东会与董事会的职权划分
- 股东会是公司的最高权力机构，负责决定公司的重大事项，包括修改公司章程。
- 董事会则是股东会的执行机构，负责执行股东会的决议，并在其职权范围内作出决策。
- 若董事会通过的决议超出了其职权范围，或未经股东会授权，股东会有权拒绝按此决议修改章程，这不构成违法。
三、法律后果与救济途径
法律后果：
- 若股东会未依法修改章程，且该行为违反了法律、行政法规或公司章程的规定，相关决议可能面临被法院宣告无效或撤销的风险。
- 公司可能需承担因未依法修改章程而产生的法律责任，如对其他股东或利益相关者的损害赔偿责任。
救济途径：
- 股东若认为股东会的决策违法或损害了其利益，可在法定期限内（如决议作出之日起六十日内）请求人民法院撤销相关决议。
- 公司也可通过内部治理机制（如召开临时股东会）来纠正错误的决策。
四、实践建议
- 审查决议内容：在决策前，应仔细审查董事会通过的决议内容是否合法、合规。
- 遵循决策程序：确保股东会的决策程序符合法律、行政法规和公司章程的规定。
- 保留证据：在决策过程中，应保留好相关会议记录、表决票等书面材料，以备后续可能出现的法律争议。
- 寻求专业帮助：若对决策过程或结果存在疑问，应及时咨询专业律师，以确保公司的决策合法、合规。
举例说明：假设某公司董事会通过了一项修改公司章程的决议，旨在增加公司的注册资本。但股东会在审议时发现，该决议未按照公司章程规定的程序进行（如未提前通知所有股东），且部分股东对增资方案表示反对。在此情况下，股东会拒绝按董事会决议修改章程，是合法的决策行为。
总结来看，股东会没有按董事会通过的决议修改章程，是否违法取决于决议内容的合法性、决策程序的合规性以及股东会与董事会的职权划分。若您对此类问题存在疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。