针对您提出的“公务员违规经商所得如何计算违纪款”的问题，这是一个涉及法律与纪律规定的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：

一、违规经商所得的定义

违规经商所得，特指公务员利用职务之便或违反相关规定，通过经商活动所获得的全部财物及其孳息。这包括但不限于通过非法手段获得的利润、分红、回扣等任何形式的非法收益。

二、违规经商所得的计算方法

在计算公务员违规经商所得时，通常会根据具体情形采用以下几种方法：

1. 成本收益核算法：

   • 这是最直接的计算方法，即用违规经商活动的总收入减去为开展该活动所支出的合理成本（如进货成本、运营费用等），得出的差额即为违规所得。
   • 举例：若某公务员违规开办了一家商店，总销售额为50万元，而合理成本（包括进货、租金、员工工资等）为35万元，则其违规所得为15万元。

2. 利润分配法：

   • 在合作、入股等形式的违规经商活动中，若存在明确的利润分配方案或出资比例、约定分配比例，则按照这些比例来计算个人违规所得。
   • 举例：若某公务员与他人合作违规经营一家企业，其出资占比为30%，且企业净利润为100万元，则该公务员的违规所得为30万元。

3. 参照市场价格法：

   • 当违规经商行为涉及商品或服务交易，且交易价格明显偏离市场价格时，可以参照市场同类商品或服务的正常价格来计算违规所得。
   • 举例：若某公务员以远低于市场价的价格销售农产品，如市场价每斤10元，而其实际售价每斤5元，且销售了5000斤，则其违规所得为25000元（即差价部分）。

4. 期间计算法：

   • 对于持续一段时间的违规经商行为，可以确定其起止时间，并计算该时间段内与经商活动相关的全部收益作为违规所得。
   • 举例：若某公务员违规经营网店一年，且该网店在这一年内的净收入为20万元，则这20万元即为其违规所得。

三、法律实践与裁量

在司法实践中，对于“违规经商所得”的认定和计算，需要遵循相关的司法解释和行政规定。同时，执法机关或法院会根据具体案件情况进行裁量，确保计算结果的准确性和合法性。这意味着，在计算违规经商所得时，不仅需要考虑上述具体的计算方法，还需要结合案件的具体事实、证据以及相关法律法规的规定进行综合判断。

四、结论与建议

违规经商行为不仅违反了公务员的职业道德和纪律规定，还可能触犯法律。因此，对于公务员而言，严格遵守相关法律法规，不进行任何形式的违规经商行为，是维护个人声誉和职业安全的必要之举。同时，对于已经发生的违规经商行为，应依法进行查处，并准确计算违规所得，以确保纪律的严肃性和法律的公正性。

希望以上解答能够对您有所帮助。如有任何进一步的问题或疑虑，请随时咨询。