关于差额单位年休假工资的承担问题，一般来说，这并非由原科室或医院单方面决定，而是需要依据具体的法律法规、单位规章制度以及劳动合同的约定来确定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、法律法规角度

根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者享有休息休假的权利，其中包括年休假。对于年休假期间的工资支付，法律通常规定用人单位应当按照劳动者正常工作时的工资标准支付。然而，对于差额单位（如部分事业单位、公立医院等可能存在的差额拨款单位）而言，其工资构成和支付方式可能具有特殊性，但这并不改变年休假工资支付的基本原则。

关键点：

• 年休假是劳动者的法定权利，用人单位应依法支付年休假工资。
• 差额单位的特殊性不影响年休假工资支付的基本法律原则。

二、单位规章制度角度

差额单位可能根据其自身情况制定有特定的规章制度，这些制度可能涉及年休假工资的支付方式、标准等。然而，这些规章制度必须符合法律法规的规定，不得侵犯劳动者的合法权益。

关键点：

• 单位规章制度应合法合规，不得违反法律法规。
• 若规章制度中有关于年休假工资的具体规定，且该规定合法，则应按照该规定执行。

三、劳动合同角度

劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。劳动合同中可能包含有关年休假工资支付的条款。若劳动合同中有明确约定，则应按照劳动合同的约定执行。

关键点：

• 劳动合同中的约定应合法有效，不得违反法律法规。
• 若劳动合同中有关于年休假工资的具体约定，则应优先遵循劳动合同的约定。

四、实际操作建议

1. 查阅法律法规：首先，应查阅相关的法律法规，了解年休假工资支付的基本原则和规定。
2. 审查单位规章制度：其次，应审查差额单位的规章制度，看是否有关于年休假工资的具体规定。
3. 核对劳动合同：然后，应核对劳动合同中的相关条款，看是否有关于年休假工资的具体约定。
4. 协商或投诉：若存在争议或不明确的地方，建议与用人单位进行协商；若协商无果，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

总结：差额单位年休假工资的承担问题并非由原科室或医院单方面决定，而是需要依据法律法规、单位规章制度以及劳动合同的约定来确定。若存在争议或不明确的地方，建议通过合法途径解决。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。