针对您提出的“不具备主体资格认定为基本农田是否有效”的问题，我们需要从几个方面来详细分析和解答。

首先，我们要明确“不具备主体资格”的含义。在法律语境下，主体资格通常指的是能够独立承担法律责任的自然人、法人或其他组织。如果某个实体不具备这样的资格，比如它是一个不具有独立法人资格的分公司、内设机构、派出机构或临时机构，那么它本身不能作为违法责任主体。

接下来，我们探讨“认定为基本农田”的效力问题。基本农田的认定是基于土地利用现状、规划以及相关法律法规的规定。这种认定通常是由自然资源部门或相关规划机构根据土地利用现状图、土地利用现状数据库以及国家永久基本农田数据库等权威数据来进行的。它并不直接依赖于实施违法行为的主体是否具备主体资格。

然而，当涉及到违法用地或占用基本农田的违法行为时，违法责任主体的认定就变得至关重要。根据《自然资源违法行为立案查处工作规程(试行)》等相关规定，违法责任主体应当是实施违法行为并且能够独立承担法律责任的自然人、法人或其他组织。如果某个不具备主体资格的实体实施了违法行为，那么其设立该实体的法人或相关责任主体将被认定为违法责任主体。

现在，我们回到原问题：“不具备主体资格认定为基本农田有效吗？”从基本农田认定的角度来看，这种认定是基于土地利用现状和规划的，与实施违法行为的主体是否具备主体资格无关。因此，基本农田的认定本身是有效的。但是，如果涉及到违法用地或占用基本农田的违法行为，并且实施该行为的主体不具备主体资格，那么违法责任将由其设立者或相关责任主体承担。

综上所述，不具备主体资格的实体本身不能作为违法责任主体，但这并不影响基本农田认定的效力。在涉及违法用地或占用基本农田的情况下，违法责任将由具备主体资格的相关责任主体承担。希望这个解答能够清晰、详细地解答您的问题。