当有限公司中的显名股东侵占了隐名股东的股权股份时，隐名股东可以采取以下措施来维护自己的权益：
协商解决：
- 沟通协商：隐名股东首先应尝试与显名股东进行友好沟通，明确指出其侵权行为，并要求其停止侵权行为并赔偿损失。这种方式成本较低，且有助于保持双方合作关系。
- 签订补充协议：若双方能达成一致，应签订补充协议，明确双方的权利义务，以防止类似侵权行为再次发生。
法律途径解决：
- 提起股东资格确认之诉：
- 确认股东身份：若显名股东否认隐名股东的股东身份，隐名股东可以向人民法院提起股东资格确认之诉。在诉讼中，隐名股东需要提供充分的证据，如出资证明、代持股协议等，以证明其实际出资并享有投资权益。
- 法律依据：根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（三）》第二十四条，实际出资人与名义出资人之间的合同，如无法律规定的无效情形，人民法院应当认定有效。实际出资人以其实际履行了出资义务为由向名义股东主张权利的，人民法院应予支持。
- 追究显名股东违约责任：
- 要求赔偿损失：若双方签订了代持股协议，且显名股东违反了协议约定，隐名股东可以依据协议要求显名股东承担违约责任，并赔偿因此造成的损失，包括直接损失和间接损失。
- 继续履行协议：隐名股东还可以要求显名股东继续履行代持股协议，按照约定行使股东权利。
- 提起侵权之诉：
- 要求停止侵权：若隐名股东因显名股东的侵权行为受到了损失，可以向人民法院提起侵权之诉，要求显名股东停止侵权行为，并消除影响。
- 损害赔偿：隐名股东还可以要求显名股东赔偿全部损失，包括经济损失和精神损失（如适用）。具体赔偿数额将由人民法院根据案件实际情况进行综合判断。
其他措施：
- 向监管部门举报：隐名股东可以向相关监管部门举报显名股东的违法行为，寻求行政干预和处罚。
- 媒体曝光：在适当情况下，隐名股东还可以通过媒体和舆论曝光显名股东的不当行为，以增加其违法成本和社会压力。
在采取上述措施时，隐名股东需要注意以下几点：
- 保留相关证据：隐名股东应收集和保留与股权相关的所有证据，包括出资证明、代持股协议、参与公司股东会议的记录、股利分配记录等。这些证据将在后续的法律程序中起到关键作用。
- 关注显名股东持股情况：隐名股东应及时了解显名股东的持股情况，防止其违反协议将股权转让或作其他处分。如发现显名股东有不当行为，应立即采取措施进行制止。
- 寻求专业法律帮助：在处理此类纠纷时，隐名股东应寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保护。
预防措施：
- 签订明确的代持股协议：在与显名股东签订代持股协议时，应明确约定双方的权利义务、股权归属、收益分配等事项，以避免未来发生纠纷。
- 及时办理股权变更登记：在条件允许的情况下，隐名股东应及时办理股权变更登记，以使自己的股东身份得到法律认可和保护。
隐名股东在面临显名股东侵权时，应根据自身情况和具体案情选择合适的维权方式，并采取相应的预防措施以避免未来纠纷的发生。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。