面对有限责任公司大股东侵占公司财物的情况，公司及股东应采取以下综合措施来维护自身权益：
收集证据：
- 首要任务是收集充分且确凿的证据，以证明大股东的侵占行为。这些证据可以包括财务报表、交易记录、合同文件、电子邮件、银行转账记录等，确保能够清晰展示侵占行为的具体细节和金额。证据的充分性和确凿性是后续采取任何法律行动的基础。
内部途径处理：
- 协商解决：尝试与大股东进行友好沟通，指出其行为的违法性和对公司造成的损害，要求其返还财产并赔偿损失。这种方式有助于维护公司内部和谐，避免矛盾升级，同时可能以较低的成本解决问题。
- 召开股东会：根据公司章程规定，召集股东会讨论侵占问题，并形成决议要求大股东返还财产。股东会决议具有权威性，可作为进一步采取措施的依据，如提起诉讼或采取其他法律行动。
- 内部监督与纠正：监事会或监事应履行监督职责，对侵占行为进行调查，并提出处理建议。必要时可聘请外部审计机构进行财务审计，以确定侵占的具体情况，为后续的法律行动提供有力支持。
- 书面要求归还：监事会或监事可以公司的名义，书面要求侵占财产的大股东归还财产，明确列出归还的期限和方式。这种方式具有正式性，能够明确表达公司的立场和要求。
确定法律责任与采取法律行动：
- 民事侵权责任：对于非公司工作人员的大股东侵占行为，公司可通过民事诉讼追究其责任，要求返还财产并赔偿损失。需提交起诉状及相关证据材料至有管辖权的人民法院，通过法律途径维护公司权益。
- 职务侵占罪：若侵占大股东同时为公司工作人员，并利用职务便利进行侵占，其行为可能构成职务侵占罪。公司可向公安机关报案，由司法机关追究其刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，侵占数额较大的将受到相应的刑事处罚，如有期徒刑、拘役或罚金等。
- 股东代表诉讼：若公司怠于通过诉讼追究侵占大股东责任，符合一定条件的股东（如连续一定时间持有公司一定比例股份的股东）可提起股东代表诉讼，以公司利益为名直接向人民法院提起诉讼。这种方式能够确保公司权益得到及时有效的保护。
行政投诉与其他途径：
- 若大股东的侵占行为涉及违反行政管理规定，如税务或市场监管问题，公司可向相关行政主管部门进行投诉，由其进行调查处理并依法作出处罚。这种方式能够借助行政力量对侵占行为进行打击和制裁。
加强内部管理：
- 为防止类似事件再次发生，公司应加强内部管理，完善财务管理制度，明确股权结构和股东权益，加强对公司财产的监督和管理。同时，应提升员工的法律意识，确保公司运营合规。通过建立健全的内部控制机制，降低公司遭受侵占的风险。
在处理此类问题时，还需注意以下几点：
- 保持冷静与理性：在面对大股东的侵占行为时，公司及股东应保持冷静与理性，避免采取过激行为或言语攻击，以免加剧矛盾或引发不必要的法律纠纷。
- 及时咨询专业律师：在处理此类复杂法律问题时，建议及时咨询专业律师的意见和建议。律师能够提供专业的法律分析和指导，帮助公司及股东制定合理的应对策略和方案。
- 关注法律动态与变化：随着法律法规的不断更新和完善，公司及股东应密切关注相关法律动态和变化，及时调整应对策略和方案，以确保公司权益得到最大程度的保护。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供详细的法律分析和建议。