违法单位不在属地时，行政处罚仍可依法进行，主要通过跨区域协作、指定管辖或直接管辖等方式实现。具体分析如下：

1. 跨区域协作机制
   根据《行政处罚法》第二十条及《市场监督管理行政处罚程序规定》，若违法单位注册地与违法行为发生地不一致，违法行为发生地（属地）监管部门有权管辖。若需注册地配合调查（如调取财务资料、约谈负责人等），属地部门可通过跨区域执法协作机制（如发函委托、联合执法）要求注册地部门协助，确保调查取证完整性。例如，某公司注册在A地，但在B地销售假冒产品，B地市场监管局可立案调查，并委托A地部门协助核查公司经营情况。

2. 指定管辖的适用
   若属地与注册地监管部门对管辖权存在争议，根据《行政处罚法》第二十五条，可由共同上一级行政机关指定管辖。例如，某公司注册在A市，违法行为发生在B市，A、B两地监管部门均主张管辖权时，可由省级市场监管部门指定其中一地管辖，避免推诿或重复处罚。

3. 直接管辖的例外情形
   对国务院或省级政府授权的部门（如国家市场监管总局、省级生态环境厅），可直接管辖跨区域重大违法行为，不受属地限制。例如，某企业跨省倾倒危险废物，生态环境部可直接立案查处，无需通过地方部门协作。

实务建议：

• 对企业而言，若收到异地监管部门调查通知，应积极配合属地部门调查，同时可要求其出示管辖权依据（如协作函、指定管辖文件）；
  
• 对监管部门，需严格遵循“违法行为发生地优先”原则，确需跨区域调查时，应通过正式公文（如协助调查函）明确协作内容，避免程序瑕疵。
  

如有具体案件需分析管辖权或协作流程，可进一步提供细节，我将结合《行政处罚法》及相关部门规章为您详细解答。