结论前置：在交通事故中，原告将保险公司和机动车司机都告上法庭并申请伤残鉴定时，机动车司机应当出庭参与诉讼。以下是具体分析：

1. 法律程序要求

• 根据《民事诉讼法》规定，被告有义务参与诉讼程序，包括出庭应诉、接受法庭调查和质证。若司机不出庭，法院可能缺席判决，导致其丧失抗辩权利（如对伤残鉴定结论的异议、责任比例划分等）。
• 伤残鉴定结果直接影响赔偿金额（如残疾赔偿金、护理费等），司机需通过质证程序对鉴定合法性、关联性提出意见，否则可能被动接受不利结果。

2. 责任划分与抗辩权

• 若司机对事故责任有异议（如认为原告存在过错），需在庭审中提供证据（如行车记录仪、证人证言等）。不出庭将导致无法主张责任减免，可能承担更高赔偿比例。
• 保险公司虽为共同被告，但其赔偿范围基于保险合同和责任认定。司机出庭可协助法庭厘清责任边界，避免保险公司以“责任免除”为由拒赔。

3. 实务建议

• 出庭必要性：司机应委托律师或自行出庭，提交证据（如驾驶证、行驶证、保险单、事故现场照片等），并申请重新鉴定（若对伤残等级有异议）。
• 调解机会：庭审中可能存在调解环节，司机可通过协商降低赔偿金额或分期支付，避免强制执行风险。
• 保险理赔衔接：司机需确保保险公司已履行查勘、定损义务，避免因程序瑕疵导致保险拒赔。

4. 例外情形

• 若司机已与原告达成和解并签署书面协议，或法院裁定中止诉讼（如等待刑事案件结果），可能暂缓出庭。但此类情形需以法院通知为准，司机不可自行决定缺席。

总结：机动车司机应积极出庭参与诉讼，行使抗辩权并维护自身权益。如有法律疑问或需协助准备证据材料，可直接向我咨询交通事故责任认定、赔偿计算及诉讼策略等问题。