若案件处于公安侦查阶段，纪检委否定案情后，公安一般会停止侦查并撤销案件。具体处理方式如下：

1. 停止侦查与撤销案件：

   • 纪检委作为党内监督机构，其否定意见通常基于对案件事实、证据或程序合法性的审查。若纪检委认为案件存在事实不清、证据不足或程序违法等问题，并明确否定案情，公安部门在收到相关反馈后，一般会停止对案件的进一步侦查。
   • 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，公安部门在侦查过程中发现案件不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，应当撤销案件。因此，若纪检委的否定意见被公安部门采纳，且符合撤销案件的法定条件，公安部门将依法撤销案件。

2. 内部审查与整改：

   • 公安部门在收到纪检委的否定意见后，除了停止侦查和撤销案件外，还会对案件进行内部审查，以查明问题所在并采取相应的整改措施。这有助于提升公安部门的执法水平和案件质量。

3. 可能的复议或申诉：

   • 若公安部门对纪检委的否定意见存在异议，或者认为案件仍有进一步侦查的必要，可以按照相关规定提出复议或申诉。然而，这一过程需要基于充分的证据和合理的理由，并遵循法定的程序和时限。

若案件已进入审查起诉或审判阶段，纪检委否定案情后，公安需配合检察机关或法院工作。具体处理方式如下：

1. 配合检察机关工作：

   • 若案件已移送检察机关审查起诉，且纪检委在此阶段否定案情，公安部门需配合检察机关的工作，提供必要的案件材料和证据。检察机关将根据纪检委的意见和案件实际情况，决定是否提起公诉或作出其他处理决定。

2. 参与庭审与辩论：

   • 若案件已进入审判阶段，且纪检委在此阶段否定案情，公安部门作为案件的侦查机关，可能需要参与庭审过程，就案件事实、证据和侦查程序等问题进行说明和辩论。这有助于法庭全面了解案件情况，作出公正的判决。

在处理过程中，公安部门需严格遵守法定程序和时限，确保案件处理的合法性和公正性。同时，公安部门也应加强与纪检委、检察机关和法院等部门的沟通协调，共同维护司法公正和法治秩序。

如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。