在刑事判决书中，关于追缴违法所得的计算和处理，是一个涉及法律程序和财产权益的重要环节。以下是对这一问题的详细解答：
一、追缴违法所得的法律依据
根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔。这意味着，一旦犯罪行为被确认，犯罪分子通过非法手段获得的财物，无论其性质、来源或去向，都应当被追缴或退赔。
二、追缴违法所得的计算原则
全面追缴：追缴违法所得应涵盖犯罪分子通过非法手段获得的所有财物，包括但不限于现金、物品、有价证券等。
价值评估：对于无法直接追缴的财物，如已消耗、转让或毁损的财物，应根据其市场价值或评估价值进行折算，并追缴相应金额的款项。
合法财产区分：在追缴过程中，应明确区分被害人的合法财产与犯罪分子的违法所得。被害人的合法财产应及时返还，而犯罪分子的违法所得则应予以追缴。
三、追缴违法所得的处理方式
返还被害人：对于被害人的合法财产，如因犯罪行为而遭受损失的财物，应在追缴后及时返还给被害人。
上缴国库：除依法返还被害人的以外，追缴的违法所得应一律上缴国库。这包括违禁品和供犯罪所用的本人财物，这些财物应予以没收并上缴国库。
特殊情形处理：对于贪污贿赂犯罪、恐怖活动犯罪等重大犯罪案件，如果犯罪嫌疑人、被告人逃匿或死亡，且依照刑法规定应当追缴其违法所得及其他涉案财产的，人民检察院可以向人民法院提出没收违法所得的申请。
四、追缴违法所得的程序要求
证据材料提供：在申请没收违法所得时，应提供与犯罪事实、违法所得相关的证据材料，并列明财产的种类、数量、所在地及查封、扣押、冻结的情况。
特定机关认定：违法所得的性质只能由国家授权的特定机关通过一定程序才能认定。这包括行政执法机关依照有关行政法规作出的没收违法所得的行政处罚，以及司法机关对刑事案件中的违法所得依法作出的追缴或退赔的裁决。
五、注意事项
程序合法性：在追缴违法所得的过程中，必须严格遵守法律程序，确保追缴行为的合法性和有效性。
权益保护：在追缴过程中，应充分保护被害人的合法权益，确保被害人的合法财产得到及时返还。
廉洁自律：司法工作人员在追缴违法所得的过程中，应严格遵守廉洁自律规定，不得贪污、挪用或私自处理查封、扣押、冻结的财物及其孳息。
综上所述，刑事判决书中的追缴违法所得是根据犯罪分子的违法行为和所得财物进行全面追缴，并依法进行处理的。在追缴过程中，应严格遵守法律程序，确保追缴行为的合法性和有效性，同时充分保护被害人的合法权益。