企业员工利用职权犯罪偷税，属于严重的违法行为，需从刑事责任、行政责任、企业内部处理三个层面综合处理。以下是具体分析：

1. 刑事责任：可能构成逃税罪或职务侵占罪

• 逃税罪：根据《刑法》第201条，员工通过隐瞒收入、虚报支出等手段偷税，数额较大且占应纳税额10%以上的，处3年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；数额巨大且占应纳税额30%以上的，处3-7年有期徒刑，并处罚金。
• 职务侵占罪：若员工利用职权将偷税所得非法占为己有（如截留税款），数额较大的，可能构成职务侵占罪（《刑法》第271条），处3年以下有期徒刑或拘役；数额巨大的，处3-10年有期徒刑，并处罚金。
• 共同犯罪：若企业负责人或财务人员与员工合谋偷税，可能按共同犯罪处理，主犯从重处罚。

2. 行政责任：税务机关的处罚

• 补缴税款与滞纳金：税务机关会责令企业限期补缴偷逃税款，并按日加收万分之五的滞纳金。
• 罚款：对偷税行为，处偷税数额50%-5倍的罚款；若构成逃避追缴欠税，处欠缴税款50%-5倍的罚款。
• 信用惩戒：企业可能被列入税收违法“黑名单”，影响融资、招投标等经营活动。

3. 企业内部处理：追责与整改

• 解除劳动合同：员工利用职权偷税属于严重违反公司规章制度的行为，企业可依据《劳动合同法》第39条解除劳动合同，且无需支付经济补偿。
• 追偿损失：若员工行为导致企业被罚款或补缴税款，企业可要求员工赔偿实际损失。
• 内部整改：企业需完善财务制度、加强审计监督，防止类似行为再次发生。

4. 处理流程建议

• 企业步骤：
  1. 立即停止员工职权，封存相关财务资料；
  2. 委托律师或税务师进行内部调查，固定证据；
  3. 向税务机关主动补缴税款、滞纳金及罚款，争取从轻处理；
  4. 视情况向公安机关报案，追究员工刑事责任。
• 员工应对：若被调查，应如实陈述事实，积极退赃，争取从宽处理（如自首、立功等）。

5. 风险提示

• 企业若未及时处理，可能被认定为“共同偷税”主体，承担连带责任。
• 员工若拒不认罪或逃避处罚，可能面临更严厉的刑事制裁。

建议：企业应定期开展税务合规培训，建立内部举报机制；员工需遵守职业道德，切勿因一时贪念触犯法律。如有具体案件或疑问，可直接向我咨询，我会结合细节提供进一步分析。