结论：关于您起诉邻居将内开门改为外开门一案，法院是否会一并处理整层其他五户的类似行为，取决于多个因素，包括案件的具体情况、法院的审理策略以及您的诉讼请求等。以下是从不同角度进行的分析。
一、法院可能单独审理您的案件
诉讼请求的独立性：
- 如果您仅起诉了邻居一户，且您的诉讼请求仅针对该户的行为，那么法院通常会单独审理此案，不会主动将其他五户纳入审理范围。
- 您的起诉状中应明确被告和诉讼请求，这是法院审理案件的基础。
案件事实的独立性：
- 即使整层有五户都进行了类似的门改行为，但每户的具体情况（如改造时间、改造方式、对公共区域的影响等）可能存在差异。
- 法院在审理时，会关注每户的具体事实，而不是一概而论。
二、法院可能合并审理相关案件
共同事实或法律问题：
- 如果法院认为整层五户的门改行为存在共同的事实或法律问题，且这些问题的解决对于案件的处理至关重要，那么法院可能会考虑合并审理。
- 例如，如果所有五户的门改行为都违反了相同的物业管理规定或建筑安全标准，且这些规定或标准的适用是案件的关键点，那么合并审理可能更为高效。
当事人的同意：
- 如果您和其他相关户主都同意合并审理，且法院认为合并审理不会损害任何一方的合法权益，那么法院可能会根据当事人的意愿进行合并。
诉讼效率的考虑：
- 合并审理可以提高诉讼效率，减少法院和当事人的诉讼成本。如果法院认为合并审理有助于快速、公正地解决纠纷，那么可能会选择合并。
三、您的策略选择
明确诉讼请求：
- 在起诉时，您应明确您的诉讼请求，即要求邻居恢复原状、赔偿损失等。这有助于法院明确审理范围。
考虑追加被告：
- 如果您认为其他五户的行为也对您造成了影响，且您希望法院一并处理，那么您可以考虑在起诉时或诉讼过程中追加被告。但需要注意的是，追加被告需要符合法律规定的条件，且可能会增加诉讼的复杂性和成本。
与法院沟通：
- 在诉讼过程中，您可以与法院沟通，了解法院对于合并审理的看法和态度。如果法院认为合并审理更为合适，且您也同意，那么您可以配合法院进行相关操作。
建议：针对您的情况，我建议您首先明确您的诉讼请求，并考虑是否需要追加其他五户为被告。同时，您可以与法院保持沟通，了解法院的审理策略和意见。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。