结论：申请工伤认定与要求对方赔偿并不冲突，二者可并行主张，但需根据不同责任主体和法律关系分别处理。以下是具体分析及操作建议：

1. 工伤认定与赔偿的独立性

• 工伤认定：根据《工伤保险条例》，劳动者在工作时间、工作场所因工作原因受伤，可向社保部门申请工伤认定。认定后，劳动者可享受工伤保险待遇（如医疗费、伤残补助金等），由工伤保险基金或用人单位支付。
• 对方赔偿：若伤害由第三方（如交通事故中的肇事方、故意伤害的侵权人）造成，劳动者可依据《民法典》侵权责任编，要求第三方承担民事赔偿责任（如医疗费、误工费、精神损害抚慰金等）。
• 关键点：工伤赔偿与第三方赔偿属于不同法律关系，可同时主张，但需避免重复获赔（如医疗费一般只能主张一次）。

2. 操作步骤与文书撰写建议

• 步骤一：申请工伤认定
  1. 向用人单位所在地社保部门提交《工伤认定申请表》、劳动关系证明、医疗诊断证明等材料。
  2. 社保部门自受理之日起60日内作出认定决定。
• 步骤二：要求对方赔偿
  1. 协商：与对方或其保险公司协商赔偿方案，明确赔偿项目及金额。
  2. 起诉：若协商不成，可向法院提起民事诉讼，需准备：
     • 起诉状（载明原告、被告信息、诉讼请求、事实与理由）；
     • 证据材料（如事故认定书、医疗记录、费用单据、工伤认定书等）；
     • 赔偿清单（列明医疗费、误工费、护理费等具体项目及计算依据）。
• 文书示例（起诉状片段）：

  
   诉讼请求：
   1. 判令被告赔偿原告医疗费XX元、误工费XX元、护理费XX元……；
   2. 本案诉讼费由被告承担。
   事实与理由：
   XX年XX月XX日，原告在履行工作职责过程中，因被告XX（过错行为）导致受伤，经认定为工伤。现依据《民法典》第XX条，要求被告承担侵权责任。
  

3. 注意事项

• 时效性：工伤认定申请需在事故发生后1年内提出；民事诉讼时效为3年，自知道或应当知道权利受损之日起计算。
• 证据保留：及时保存事故现场照片、证人联系方式、医疗记录等证据。
• 专业协助：若涉及复杂法律程序（如工伤与侵权竞合、赔偿标准计算），建议委托律师处理，以确保权益最大化。

总结：申请工伤认定后，仍可要求对方赔偿，但需根据责任主体选择正确途径。如有具体案件细节或文书撰写需求，可直接向我咨询，我将提供针对性指导。