补充协议只有一方签字，在通常情况下是无效的。这是因为合同的成立往往要求双方当事人达成合意，即双方需要对合同条款取得一致意见并且签字认可。一方签字的补充协议，仅仅体现了这一方的意愿，并不能被视作双方的共同意愿表达。
特殊情况分析
不过，也存在一些特殊情况，使得仅有一方签字的补充协议可能具有法律效力：
对方认可并实际履行：如果一方签字的补充协议得到了另一方的认可，并且另一方在实际行动中按照补充协议的内容履行了相应的义务，那么这种行为可以视为对补充协议的默认或追认。在这种情况下，补充协议可能被视为有效。但需要注意的是，这种情况仍然存在一定的法律风险，因为双方可能对追认的事实或范围产生争议。
交易习惯或行业惯例：在某些特定的交易习惯或行业惯例中，可能存在一方签字即视为双方合意的情况。然而，这种情况非常罕见，且需要具体的证据来支持。
法律建议
重新协商并签字确认：为了避免潜在的法律纠纷，最稳妥的做法是让双方重新进行协商，并就补充协议的内容达成一致后签字确认。这样可以确保补充协议的法律效力，并减少后续可能出现的争议。
保留相关证据：如果一方已经签字，而另一方尚未签字但表示认可或已经实际履行，那么签字方应保留相关证据，如对方的书面认可、实际履行的记录等。这些证据在后续可能出现的纠纷中可能起到关键作用。
寻求法律帮助：如果双方对补充协议的效力存在争议，或者无法就补充协议的内容达成一致，那么建议寻求专业的法律帮助。律师可以根据具体情况提供法律意见，并帮助双方解决争议。
可能的法律后果
如果仅有一方签字的补充协议被认定为无效，那么双方可能无法依据该补充协议来主张权利或履行义务。这可能导致双方需要重新协商并签订新的协议，或者依据原合同来处理相关事宜。在某些情况下，无效的补充协议还可能引发法律纠纷，导致双方需要承担额外的法律责任和费用。
综上所述，补充协议只有一方签字在通常情况下是无效的，但存在特殊情况可能使其有效。为了确保补充协议的法律效力并减少潜在的法律纠纷，建议双方在签订补充协议时务必确保双方都签字认可。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。