如果车辆在购买保险后没有非法营运，发生事故时商业险是会赔偿的。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 保险赔偿的基本原则

• 保险赔偿是基于保险合同的约定，在保险事故发生时，由保险公司按照合同规定向被保险人或受益人支付保险金的行为。
• 在本问题中，关键在于车辆是否在进行非法营运。若车辆在购买保险后并未进行非法营运，而是作为普通车辆使用，并在此期间发生事故，那么根据保险合同的约定，商业险是应当赔偿的。

二. 非法营运对保险赔偿的影响

• 如果车辆在购买保险后进行非法营运，这通常会被视为违反了保险合同中的使用规定，保险公司有权拒绝赔偿。
• 但在本问题中，已明确车辆在购买保险后没有进行非法营运，因此这一情形不适用。

三. 法律依据

• 根据《中华人民共和国保险法》的相关规定，保险合同是投保人与保险人约定保险权利义务关系的协议。保险人应当按照保险合同的约定承担赔偿或者给付保险金的责任。
• 在本问题中，由于车辆在购买保险后并未进行非法营运，因此保险公司应当按照保险合同的约定，在保险事故发生时承担赔偿保险金的责任。

综上所述，如果车辆在购买保险后没有非法营运，发生事故时商业险是会赔偿的。这是因为保险赔偿是基于保险合同的约定，而车辆在购买保险后并未违反合同中的使用规定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。