结论：若私家车虽曾跑过黑车，但发生事故时并非处于非法营运状态，商业险是否赔偿需结合保险合同具体条款、事故具体情况及保险公司的举证情况综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、保险合同条款的审查
保险合同中的免责条款：
- 首先，需要仔细审查您与保险公司签订的商业险合同，特别是其中的免责条款部分。通常，保险公司会在合同中明确列出哪些情况下保险公司不承担赔偿责任，如非法营运、酒驾、无证驾驶等。
- 如果合同中明确规定了“非法营运”为免责事由，且保险公司能够证明事故发生时车辆正处于非法营运状态，那么保险公司有权拒绝赔偿。但关键在于，事故发生时车辆是否确实处于非法营运状态。
保险合同的解释原则：
- 如果保险合同中的免责条款存在模糊或歧义，根据《保险法》的相关规定，应当作出有利于被保险人的解释。这意味着，如果保险公司无法清晰证明事故发生时车辆处于非法营运状态，那么其拒绝赔偿的理由可能不成立。
二、事故具体情况的考量
事故发生时的车辆状态：
- 您提到事故发生时并非非法营运，这是关键事实。如果事故发生时车辆是处于私人使用状态，如家庭出行、朋友聚会等，且没有证据表明车辆正在从事非法营运活动，那么保险公司以“非法营运”为由拒绝赔偿可能缺乏依据。
事故责任的认定：
- 交通事故的责任认定通常由交警部门根据事故现场情况、证人证言、监控视频等证据进行。如果事故责任认定书中未提及车辆非法营运，那么这进一步支持了事故发生时车辆并非处于非法营运状态的观点。
三、保险公司的举证责任
保险公司的举证义务：
- 根据法律规定，保险公司如果主张免责，需要承担举证责任。即，保险公司需要提供充分的证据证明事故发生时车辆处于非法营运状态，否则其拒绝赔偿的主张可能不被法院支持。
证据的收集与审查：
- 如果保险公司提出了相关证据，您有权对这些证据进行审查和反驳。例如，您可以提供事故发生时的行车记录、乘客证言、支付记录等证据，证明车辆并非处于非法营运状态。
四、建议与行动
与保险公司协商：
- 首先，您可以尝试与保险公司进行协商，说明事故发生时的具体情况，提供相关证据，争取保险公司重新考虑赔偿决定。
寻求法律援助：
- 如果协商无果，您可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师（即我，胡林海律师，专注于经济纠纷、刑事辩护、交通事故领域），了解您的法律权益和可能的维权途径。
提起诉讼：
- 在必要时，您可以向法院提起诉讼，要求保险公司履行赔偿义务。法院将根据双方提供的证据和法律规定进行裁决。
总结：面对商业险拒绝赔偿的情况，关键在于证明事故发生时车辆并非处于非法营运状态。您可以通过审查保险合同条款、收集事故相关证据、与保险公司协商以及寻求法律援助等方式来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。