关于您提出的“不是独立法人的公司不能申请大学生就业补助吗”这一问题，我需要结合相关政策规定来为您详细解答。

首先，我们需要明确的是，大学生就业补助的申请条件通常与企业的性质、吸纳就业的情况以及是否符合政策要求等因素有关，而并非单纯取决于企业是否为独立法人。从您提供的参考信息中，我们可以看到，以《昆明市人民政府关于进一步做好当前和今后一个时期就业创业工作的实施意见》为例，它主要关注的是企业是否属于昆明市域内的园区企业、招商引资落地企业或非国有企业，以及这些企业是否当年招用了城乡劳动者，并签订了1年以上期限的劳动合同，依法缴纳了社会保险并稳定就业6个月以上。

对于非国有企业，政策中并未明确要求其必须为独立法人才能申请大学生就业补助。非国有企业主要指的是国有独资企业和国有控股比例50%及以上的企业以外的企业。这意味着，只要您的企业符合非国有企业的定义，并且满足了政策中关于吸纳就业、签订劳动合同、缴纳社会保险和稳定就业等条件，就有可能申请到大学生就业补助。

当然，不同地区的政策可能存在差异，具体申请条件还需以当地政府发布的最新政策为准。因此，我建议您在申请前，先仔细阅读当地政府发布的关于大学生就业补助的申请指南或政策文件，确保您的企业符合所有申请条件。

此外，我还想提醒您的是，申请大学生就业补助时，通常需要准备一系列的材料，如企业资质证明、劳动合同、社会保险缴纳证明等。因此，在申请前，请务必准备好所有必要的材料，并确保它们的真实性和完整性。

综上所述，不是独立法人的公司并不一定不能申请大学生就业补助。关键在于您的企业是否符合当地政策中关于企业性质、吸纳就业等条件的要求。如果您对此仍有疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询当地政府或相关部门。