公司停产假期间扣除加班工资是不合法的。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律背景

根据《中华人民共和国劳动法》和《女职工劳动保护特别规定》等相关法律法规，女职工在产假期间享有法定的生育津贴或者由用人单位按照原工资标准支付工资，且在此期间，女职工不应被安排从事任何工作，包括加班。因此，公司无权在女职工产假期间扣除其加班工资，因为产假期间女职工本身就不应存在加班的情况。

二、法律建议

1. 与公司沟通：

   • 首先，您可以尝试与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，明确表达您的权益和诉求，要求公司按照法律规定支付您产假期间的工资，并不得扣除所谓的“加班工资”。

2. 收集证据：

   • 如果公司拒绝支付或扣除工资，您需要收集相关证据，如工资条、考勤记录、产假证明等，以证明公司存在违法行为。

3. 向劳动监察部门投诉：

   • 如果与公司沟通无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉，请求他们介入调查并维护您的合法权益。

4. 申请劳动仲裁或提起诉讼：

   • 如果劳动监察部门无法解决问题，或者您对处理结果不满意，您可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者直接向人民法院提起诉讼，要求公司支付拖欠的工资并承担相应的法律责任。

三、可能的法律后果

如果公司坚持在产假期间扣除加班工资，且拒绝改正，那么公司可能面临以下法律后果：

1. 支付拖欠的工资及经济补偿：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，公司需要支付拖欠的工资，并可能因违法行为而支付经济补偿。

2. 受到行政处罚：

   • 劳动监察部门有权对公司进行行政处罚，如罚款、责令改正等。

3. 影响企业信誉：

   • 公司的违法行为可能损害其企业形象和信誉，对未来的招聘、合作等产生不利影响。

温馨提示：作为劳动者，您有权享受法定的产假和工资待遇。如果公司存在违法行为，您应积极维护自己的合法权益。如果您在此过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。